133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3323 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3323  acetyltransferase  100 
 
 
176 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1220  acetyltransferase  90.34 
 
 
176 aa  333  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1219  acetyltransferase  90.34 
 
 
176 aa  332  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0886873  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1290  acetyltransferase  89.77 
 
 
176 aa  330  5e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0542587  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2665  GCN5-related N-acetyltransferase  81.82 
 
 
177 aa  298  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0357871  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  62.29 
 
 
174 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139138 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  62.29 
 
 
174 aa  228  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621797 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  61.71 
 
 
174 aa  227  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3014  GCN5-related N-acetyltransferase  61.14 
 
 
174 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1299  GCN5-related N-acetyltransferase  40.86 
 
 
180 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2371  hypothetical protein  42.01 
 
 
320 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.896111  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0261  hypothetical protein  36.91 
 
 
150 aa  91.3  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0266  hypothetical protein  36.91 
 
 
150 aa  91.3  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0229  hypothetical protein  36.91 
 
 
150 aa  91.3  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00229  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  34.9 
 
 
150 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00232  hypothetical protein  34.9 
 
 
150 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0279  hypothetical protein  35.57 
 
 
150 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0288  hypothetical protein  35.33 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.867365  normal  0.217589 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  32.34 
 
 
158 aa  82  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  37.24 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3514  acetyltransferase  31.79 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.191622 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1060  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
161 aa  77  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2759  acetyltransferase  34.21 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3373  GCN5-related N-acetyltransferase  36.29 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1855  acetyltransferase  30.87 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  37.32 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2088  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814852  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1489  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170228  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1357  GCN5-related N-acetyltransferase  27.88 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1298  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3474  acetyltransferase  28.4 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000407854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3757  acetyltransferase  28.4 
 
 
159 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162031  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
166 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1387  GCN5-related N-acetyltransferase  28.37 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678698  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.313385  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3500  acetyltransferase  34.01 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.867974  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2666  GCN5-related N-acetyltransferase  25.82 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0312822  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  28.65 
 
 
160 aa  62  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
174 aa  61.6  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3828  acetyltransferase, gnat family  28.4 
 
 
159 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0142  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 
162 aa  60.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2811  acetyltransferase  33.33 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0136  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
167 aa  60.1  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  28.37 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  26.04 
 
 
166 aa  59.7  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02546  hypothetical protein  28.19 
 
 
159 aa  59.7  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1363  GCN5-related N-acetyltransferase  28.37 
 
 
169 aa  58.5  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.933433  hitchhiker  0.000190742 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3015  GCN5-related N-acetyltransferase  28.37 
 
 
169 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 
164 aa  58.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3324  acetyltransferase  26.04 
 
 
203 aa  57.8  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0887  acetyltransferase  28.26 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1219  acetyltransferase  26.63 
 
 
173 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3158  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3495  GCN5-related N-acetyltransferase  27.49 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000137557  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1251  GCN5-related N-acetyltransferase  27.07 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  28.07 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0803543  normal  0.0847083 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
181 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167968 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1473  acetyltransferase  29.85 
 
 
128 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000250439  hitchhiker  0.00000579727 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3557  GCN5-related N-acetyltransferase  26.9 
 
 
154 aa  54.7  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1538  GCN5-related N-acetyltransferase  24.82 
 
 
170 aa  54.7  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2663  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
168 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00980535  normal  0.156776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1289  acetyltransferase  26.04 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0040  acetyltransferase  25.52 
 
 
150 aa  54.3  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2718  acetyltransferase  28.37 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 
174 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003587  acetyltransferase GNAT family  23.98 
 
 
155 aa  52  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0451  acetyltransferase  28.3 
 
 
156 aa  51.6  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.896782  normal  0.723991 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3725  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
160 aa  51.6  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 
166 aa  51.2  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545017  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1218  acetyltransferase  25.44 
 
 
173 aa  51.2  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.148458  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2531  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
291 aa  50.8  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.801418  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179345 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32910  acetyltransferase  34.83 
 
 
154 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07944  conserved hypothetical protein  40.35 
 
 
226 aa  49.7  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7229  GCN5-related N-acetyltransferase  26.06 
 
 
184 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0199  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0940  GCN5-related N-acetyltransferase  31.63 
 
 
161 aa  48.5  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1062  GCN5-related N-acetyltransferase  30.38 
 
 
169 aa  48.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.719877  normal  0.0800979 
 
 
-
 
NC_003296  RS05473  putative acyltransferase protein  28.19 
 
 
155 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  35.48 
 
 
319 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17770  acetyltransferase  35.35 
 
 
157 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.356632 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2134  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.87 
 
 
148 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2902  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.176434  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  21.3 
 
 
154 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1433  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
153 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  35.48 
 
 
319 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0208  hypothetical protein  28.3 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2424  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.77 
 
 
148 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0214  hypothetical protein  28.3 
 
 
171 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0127  hypothetical protein  36.92 
 
 
391 aa  45.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2016  GCN5-related N-acetyltransferase  25.81 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059884  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1656  GCN5-related N-acetyltransferase  32.71 
 
 
175 aa  45.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0792  acetyltransferase (GNAT) family protein  34.78 
 
 
167 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00131347  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09493  conserved hypothetical protein  42.11 
 
 
222 aa  44.7  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.163645  normal  0.596121 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06629  acetyltransferase  30.11 
 
 
152 aa  44.3  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>