88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1218 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1218  acetyltransferase  100 
 
 
173 aa  357  4e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.148458  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1289  acetyltransferase  97.69 
 
 
173 aa  345  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1219  acetyltransferase  95.95 
 
 
173 aa  340  5e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3324  acetyltransferase  86.14 
 
 
203 aa  298  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2666  GCN5-related N-acetyltransferase  73.81 
 
 
170 aa  265  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0312822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3158  GCN5-related N-acetyltransferase  67.28 
 
 
203 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  67.9 
 
 
173 aa  239  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3015  GCN5-related N-acetyltransferase  67.9 
 
 
169 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1363  GCN5-related N-acetyltransferase  66.67 
 
 
169 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.933433  hitchhiker  0.000190742 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  47.34 
 
 
177 aa  164  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  49.39 
 
 
181 aa  155  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167968 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  47.24 
 
 
166 aa  155  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1298  GCN5-related N-acetyltransferase  46.34 
 
 
166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1538  GCN5-related N-acetyltransferase  45.73 
 
 
170 aa  150  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1251  GCN5-related N-acetyltransferase  44 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2371  hypothetical protein  35.58 
 
 
320 aa  97.4  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.896111  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1855  acetyltransferase  28.83 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212517 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1387  GCN5-related N-acetyltransferase  26.83 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678698  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1357  GCN5-related N-acetyltransferase  27.44 
 
 
163 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2759  acetyltransferase  29.34 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  26.06 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1299  GCN5-related N-acetyltransferase  25.95 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 
169 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0040  acetyltransferase  26.75 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3757  acetyltransferase  25.15 
 
 
159 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162031  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 
166 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
169 aa  61.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.313385  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 
167 aa  61.2  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3495  GCN5-related N-acetyltransferase  24.54 
 
 
159 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000137557  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2718  acetyltransferase  26.97 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3828  acetyltransferase, gnat family  23.93 
 
 
159 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  30.32 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3474  acetyltransferase  24.32 
 
 
159 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000407854  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3185  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 
159 aa  58.5  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.082232  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0142  GCN5-related N-acetyltransferase  26.62 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3514  acetyltransferase  26.8 
 
 
156 aa  57.4  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.191622 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  23.93 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3014  GCN5-related N-acetyltransferase  25.75 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1060  GCN5-related N-acetyltransferase  29.61 
 
 
161 aa  57.4  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  25.75 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  25.75 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  25.75 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3500  acetyltransferase  27.67 
 
 
166 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.867974  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2665  GCN5-related N-acetyltransferase  27.41 
 
 
177 aa  54.7  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0357871  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2811  acetyltransferase  25.33 
 
 
178 aa  54.3  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  25.31 
 
 
166 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545017  normal  0.907413 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3373  GCN5-related N-acetyltransferase  30.37 
 
 
124 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0261  hypothetical protein  28.05 
 
 
150 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0266  hypothetical protein  28.05 
 
 
150 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00229  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  26.83 
 
 
150 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00232  hypothetical protein  26.83 
 
 
150 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0229  hypothetical protein  28.05 
 
 
150 aa  53.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  23.18 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2088  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 
166 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003587  acetyltransferase GNAT family  24.48 
 
 
155 aa  51.6  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
166 aa  51.6  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814852  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0279  hypothetical protein  28.08 
 
 
150 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3557  GCN5-related N-acetyltransferase  23.29 
 
 
154 aa  51.6  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3685  GCN5-related N-acetyltransferase  23.31 
 
 
173 aa  51.2  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1290  acetyltransferase  28.36 
 
 
176 aa  50.8  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0542587  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3323  acetyltransferase  25.44 
 
 
176 aa  51.2  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1219  acetyltransferase  28.36 
 
 
176 aa  50.8  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0886873  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0288  hypothetical protein  26.83 
 
 
150 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.867365  normal  0.217589 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3001  GCN5-related N-acetyltransferase  24.68 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1220  acetyltransferase  27.61 
 
 
176 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  23.24 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0803543  normal  0.0847083 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1473  acetyltransferase  24.26 
 
 
128 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000250439  hitchhiker  0.00000579727 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0136  GCN5-related N-acetyltransferase  24.5 
 
 
167 aa  49.3  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  28.31 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02546  hypothetical protein  21.77 
 
 
159 aa  48.5  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05473  putative acyltransferase protein  27.61 
 
 
155 aa  48.5  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0451  acetyltransferase  28.36 
 
 
156 aa  47.8  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.896782  normal  0.723991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2328  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000658467  normal  0.508858 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1489  GCN5-related N-acetyltransferase  25.83 
 
 
166 aa  45.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170228  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3814  GCN5-related N-acetyltransferase  22.36 
 
 
177 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0689  acetyltransferase  24.17 
 
 
155 aa  44.3  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00474298  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0154  GCN5-related N-acetyltransferase  34.43 
 
 
150 aa  44.3  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  26.42 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2381  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1001  acetyltransferase  22.58 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.219128  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10731  GCN5-related N-acetyltransferase  24.39 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2040  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 
161 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2410  acetyltransferase, GNAT family  26.8 
 
 
165 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1976  GCN5-related N-acetyltransferase  30.17 
 
 
146 aa  41.2  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2119  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
148 aa  40.8  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175138  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1206  acetyltransferase  22.32 
 
 
141 aa  40.8  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.455023  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1082  acetyltransferase  22.32 
 
 
141 aa  40.8  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>