136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2371 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2371  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  660    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.896111  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  43.21 
 
 
174 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  43.21 
 
 
174 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139138 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  43.21 
 
 
174 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3014  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 
174 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1299  GCN5-related N-acetyltransferase  39.2 
 
 
180 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3323  acetyltransferase  42.01 
 
 
176 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1219  acetyltransferase  42.01 
 
 
176 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0886873  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1290  acetyltransferase  42.01 
 
 
176 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0542587  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1220  acetyltransferase  42.07 
 
 
176 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2665  GCN5-related N-acetyltransferase  41.98 
 
 
177 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0357871  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  36.02 
 
 
166 aa  105  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3158  GCN5-related N-acetyltransferase  37.11 
 
 
203 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2666  GCN5-related N-acetyltransferase  35.58 
 
 
170 aa  102  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0312822  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1251  GCN5-related N-acetyltransferase  37.35 
 
 
185 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  36.48 
 
 
173 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3015  GCN5-related N-acetyltransferase  36.48 
 
 
169 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1289  acetyltransferase  36.2 
 
 
173 aa  99.4  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1363  GCN5-related N-acetyltransferase  36.48 
 
 
169 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.933433  hitchhiker  0.000190742 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1219  acetyltransferase  35.58 
 
 
173 aa  99  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1218  acetyltransferase  35.58 
 
 
173 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.148458  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  36.18 
 
 
177 aa  96.7  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3324  acetyltransferase  35.58 
 
 
203 aa  95.9  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
181 aa  89  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167968 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1298  GCN5-related N-acetyltransferase  35.1 
 
 
166 aa  86.3  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1538  GCN5-related N-acetyltransferase  29.88 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1060  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1855  acetyltransferase  34.44 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212517 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3828  acetyltransferase, gnat family  29.29 
 
 
159 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  33.97 
 
 
158 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3757  acetyltransferase  28.48 
 
 
159 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2088  GCN5-related N-acetyltransferase  35.57 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3474  acetyltransferase  28.48 
 
 
159 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000407854  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  36.62 
 
 
169 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.313385  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0803543  normal  0.0847083 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3495  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000137557  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  34.9 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1489  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
166 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170228  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2759  acetyltransferase  33.96 
 
 
157 aa  73.9  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0261  hypothetical protein  31.37 
 
 
150 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0266  hypothetical protein  31.37 
 
 
150 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0229  hypothetical protein  31.37 
 
 
150 aa  74.3  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  35.04 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  37.32 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  32.16 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814852  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3500  acetyltransferase  32.35 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.867974  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0279  hypothetical protein  34.64 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3557  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0142  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00229  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  29.41 
 
 
150 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3373  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
124 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 
166 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00232  hypothetical protein  29.41 
 
 
150 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003587  acetyltransferase GNAT family  28.87 
 
 
155 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 
166 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545017  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  30.32 
 
 
160 aa  67  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3514  acetyltransferase  29.41 
 
 
156 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.191622 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  28.1 
 
 
155 aa  67  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  67  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0288  hypothetical protein  30.07 
 
 
150 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.867365  normal  0.217589 
 
 
-
 
NC_003296  RS05473  putative acyltransferase protein  33.12 
 
 
155 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1357  GCN5-related N-acetyltransferase  28.69 
 
 
163 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
160 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0451  acetyltransferase  27.63 
 
 
156 aa  63.9  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.896782  normal  0.723991 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1387  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
164 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678698  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  32.84 
 
 
174 aa  63.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0136  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 
167 aa  62.8  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2811  acetyltransferase  32.64 
 
 
178 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02546  hypothetical protein  24.65 
 
 
159 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1473  acetyltransferase  26.96 
 
 
128 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000250439  hitchhiker  0.00000579727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
164 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3685  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
173 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2718  acetyltransferase  26.62 
 
 
156 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  33.66 
 
 
184 aa  57  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179345 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0040  acetyltransferase  24.65 
 
 
150 aa  56.2  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2112  putative acetyltransferase  34.67 
 
 
280 aa  53.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1833  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
147 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164385  normal  0.0598732 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1383  acyltransferase-like protein  42.19 
 
 
170 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569267  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5516  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0715522  normal  0.230819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1774  hypothetical protein  40.91 
 
 
148 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0222  GCN5-related protein N-acetyltransferase  33.03 
 
 
201 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0887  acetyltransferase  26.53 
 
 
164 aa  49.3  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  39.24 
 
 
169 aa  49.3  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  24.82 
 
 
154 aa  49.3  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7262  acetyltransferase  28.15 
 
 
157 aa  49.3  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2130  GCN5-related N-acetyltransferase  21.77 
 
 
163 aa  49.3  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1429  GCN5-related N-acetyltransferase  37.88 
 
 
142 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.097269  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  37.08 
 
 
153 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4456  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.9 
 
 
150 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2997  GCN5-related N-acetyltransferase  44.26 
 
 
166 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4025  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
157 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636183  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6642  GCN5-related N-acetyltransferase  30.21 
 
 
154 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193882  normal  0.0657736 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6142  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
154 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.189087  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0785  putative acetyltransferase  32.38 
 
 
296 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6365  GCN5-related N-acetyltransferase  32.11 
 
 
300 aa  46.2  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25620  acetyltransferase  32.43 
 
 
154 aa  46.2  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0439  transketolase  31.11 
 
 
146 aa  46.2  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2975  acetyltransferase  36.11 
 
 
164 aa  46.2  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1888  acetyltransferase  31.19 
 
 
161 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.789075  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6669  GCN5-related N-acetyltransferase  32.11 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.097443  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>