225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2073 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2073  acetyltransferase  100 
 
 
171 aa  351  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.539818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  97.28 
 
 
147 aa  292  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1583  GCN5-related N-acetyltransferase  94.48 
 
 
147 aa  284  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.241849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3901  acetyltransferase  60.14 
 
 
143 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0744234  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45980  putative acetyltransferase  60.84 
 
 
143 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3445  GCN5-related N-acetyltransferase  56.64 
 
 
144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1398  GCN5-related N-acetyltransferase  52.74 
 
 
147 aa  160  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3747  GCN5-related N-acetyltransferase  60.74 
 
 
150 aa  158  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2949  GCN5-related N-acetyltransferase  49.63 
 
 
143 aa  141  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2741  GCN5-related N-acetyltransferase  49.63 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.326397  normal  0.640285 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1722  GCN5-related N-acetyltransferase  49.63 
 
 
149 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00703201  hitchhiker  0.00198196 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2662  GCN5-related N-acetyltransferase  48.25 
 
 
150 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.362327  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2628  GCN5-related N-acetyltransferase  48.25 
 
 
278 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2972  GCN5-related N-acetyltransferase  48.89 
 
 
148 aa  135  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0451042 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0122  hypothetical protein  47.48 
 
 
153 aa  135  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0546577 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2760  GCN5-related N-acetyltransferase  49.25 
 
 
146 aa  134  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.646196  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0463  GCN5-related N-acetyltransferase  46.75 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6096  hypothetical protein  47.48 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.164941  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1981  hypothetical protein  47.48 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3024  acetyltransferase  44.06 
 
 
145 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2948  GCN5-related N-acetyltransferase  45.93 
 
 
143 aa  132  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.22282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3089  GCN5-related N-acetyltransferase  51.49 
 
 
146 aa  130  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145585  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3359  hypothetical protein  46.04 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2005  hypothetical protein  46.04 
 
 
149 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  42.66 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0731728  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5293  hypothetical protein  45.45 
 
 
173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0283195 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6588  hypothetical protein  45.07 
 
 
146 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.745421  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1179  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
155 aa  124  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4376  GCN5-related N-acetyltransferase  46.04 
 
 
145 aa  123  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.246785 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28150  acetyltransferase  50 
 
 
158 aa  122  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02191  hypothetical protein  42.18 
 
 
196 aa  122  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  46.56 
 
 
144 aa  120  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333546  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2430  GCN5-related N-acetyltransferase  45.32 
 
 
145 aa  120  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.795815  normal  0.63662 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  44.85 
 
 
164 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.193285 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2287  GCN5-related N-acetyltransferase  39.85 
 
 
145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4017  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
151 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4246  hypothetical protein  40 
 
 
147 aa  111  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4554  hypothetical protein  40 
 
 
147 aa  111  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.321988  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2187  GCN5-related N-acetyltransferase  38.19 
 
 
153 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.937867  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4392  hypothetical protein  40.85 
 
 
145 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.72967  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4517  hypothetical protein  40.85 
 
 
145 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0536703  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4427  hypothetical protein  40.85 
 
 
145 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.499385  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4609  GCN5-related N-acetyltransferase  37.06 
 
 
143 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000167629  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4514  hypothetical protein  40.85 
 
 
145 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.109422 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3985  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5482  hypothetical protein  40 
 
 
147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03884  predicted acetyltransferase  39.29 
 
 
147 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4224  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
151 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03844  hypothetical protein  39.29 
 
 
147 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.194334  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4018  hypothetical protein  39.29 
 
 
147 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.131237 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4590  hypothetical protein  40.14 
 
 
145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.992434  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1223  GCN5-related N-acetyltransferase  43.7 
 
 
151 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198418  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1192  acetyltransferase  43.7 
 
 
162 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.261009  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0333  putative acetyltransferase  42.11 
 
 
148 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03080  putative acetyltransferase  39.57 
 
 
148 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.043111  hitchhiker  0.000000418367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1391  GCN5-related N-acetyltransferase  40.15 
 
 
146 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.858282  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2721  GCN5-related N-acetyltransferase  41.35 
 
 
154 aa  100  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4020  acetyltransferase, GNAT family  40.88 
 
 
146 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0469  acetyltransferase  40 
 
 
141 aa  99  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0240937  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0595  acetyltransferase  35.56 
 
 
147 aa  94.4  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0736  GCN5-related N-acetyltransferase  35.42 
 
 
149 aa  88.2  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0436  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
143 aa  88.2  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189459  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1199  acetyltransferase  32.06 
 
 
147 aa  87.8  7e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2857  GCN5-related N-acetyltransferase  36.69 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42306  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0469  GCN5-related N-acetyltransferase  36.44 
 
 
147 aa  77.4  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2607  acetyltransferase  31.34 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0432  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617149  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0750  GCN5-related N-acetyltransferase  31.88 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.620129  normal  0.699411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4128  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000338404  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2038  acetyltransferase  32.31 
 
 
150 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0329  putative acetyltransferase  31.34 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1581  GCN5-related N-acetyltransferase  31.01 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0579775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2531  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
291 aa  71.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.801418  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2585  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000324557 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03400  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  31.4 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03351  hypothetical protein  31.4 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3975  hypothetical protein  31.4 
 
 
146 aa  70.5  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1998  acetyltransferase (GNAT) family protein  31.45 
 
 
140 aa  70.5  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0762765  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
141 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0922659  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0162  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4927  hypothetical protein  31.4 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4133  hypothetical protein  33.06 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3965  hypothetical protein  33.88 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.819942  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3838  hypothetical protein  33.88 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3857  hypothetical protein  33.88 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4026  hypothetical protein  33.88 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0298  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0148  GCN5-related N-acetyltransferase  36.29 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3872  hypothetical protein  30.58 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0166  hypothetical protein  30.58 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4046  hypothetical protein  30.58 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3751  hypothetical protein  30.58 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3786  hypothetical protein  32.26 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3922  hypothetical protein  33.06 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.768766 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0020  hypothetical protein  31.45 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142061  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0063  hypothetical protein  31.93 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0724  acetyltransferase  25 
 
 
154 aa  58.9  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.268912  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3373  GCN5-related N-acetyltransferase  33.7 
 
 
124 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0279  hypothetical protein  30.87 
 
 
150 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2340  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
168 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>