129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1874 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
169 aa  348  2e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0582  GCN5-related N-acetyltransferase  54.49 
 
 
165 aa  183  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0137231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3185  GCN5-related N-acetyltransferase  47.13 
 
 
159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.082232  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3001  GCN5-related N-acetyltransferase  47.17 
 
 
159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4025  GCN5-related N-acetyltransferase  46.2 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636183  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2410  acetyltransferase, GNAT family  43.29 
 
 
165 aa  144  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2040  GCN5-related N-acetyltransferase  44.03 
 
 
161 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2975  acetyltransferase  42.5 
 
 
164 aa  136  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7262  acetyltransferase  42.68 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3814  GCN5-related N-acetyltransferase  42.04 
 
 
177 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0733  GCN5-related N-acetyltransferase  40.36 
 
 
169 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.881941  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3289  GCN5-related N-acetyltransferase  40.36 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3401  GCN5-related N-acetyltransferase  40.96 
 
 
170 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0877  acetyltransferase  40 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3487  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
174 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3125  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
180 aa  105  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018265  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0887  GCN5-related N-acetyltransferase  38.79 
 
 
173 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0061391  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0852  GCN5-related N-acetyltransferase  38.41 
 
 
168 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.623177  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0875  GCN5-related N-acetyltransferase  38.18 
 
 
169 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183729  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3423  GCN5-related N-acetyltransferase  34.59 
 
 
154 aa  90.5  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.679599  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1433  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1850  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000283467  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2016  GCN5-related N-acetyltransferase  32.05 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059884  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0578  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
72 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.573636  normal  0.133942 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  32.3 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02546  hypothetical protein  27.85 
 
 
159 aa  62  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545017  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6142  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.189087  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0199  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1299  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
180 aa  57.8  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2130  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
163 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7229  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179345 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003587  acetyltransferase GNAT family  25.16 
 
 
155 aa  55.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0781  GCN5-related N-acetyltransferase  28.39 
 
 
162 aa  55.1  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6333  acetyltransferase  29.17 
 
 
156 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0488067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0288  hypothetical protein  31.34 
 
 
150 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.867365  normal  0.217589 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3828  acetyltransferase, gnat family  26.87 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0279  hypothetical protein  30.6 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1357  GCN5-related N-acetyltransferase  23.9 
 
 
163 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2749  GCN5-related N-acetyltransferase  28.8 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0261  hypothetical protein  29.85 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0266  hypothetical protein  29.85 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3256  GCN5-related N-acetyltransferase  29.21 
 
 
298 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14323  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0229  hypothetical protein  29.85 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  29.3 
 
 
174 aa  52  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.631657  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1387  GCN5-related N-acetyltransferase  27.88 
 
 
164 aa  51.2  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678698  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  37.68 
 
 
143 aa  50.8  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0887  acetyltransferase  26.38 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133756 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00229  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  30.88 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2371  hypothetical protein  39.24 
 
 
320 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.896111  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00232  hypothetical protein  30.88 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6702  GCN5-related N-acetyltransferase  33.82 
 
 
159 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  30.88 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26100  predicted acetyltransferase  29.55 
 
 
153 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1659  hypothetical protein  26.32 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1218  acetyltransferase  31.63 
 
 
155 aa  48.9  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.065696  normal  0.121515 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0109  GCN5-related N-acetyltransferase  35.58 
 
 
202 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3474  acetyltransferase  27.61 
 
 
159 aa  47.8  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000407854  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  31.73 
 
 
155 aa  47.8  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 
174 aa  47.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1605  GCN5-related N-acetyltransferase  33.61 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.735918  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6226  GCN5-related N-acetyltransferase  33.61 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0286732 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1060  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 
161 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
160 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6642  GCN5-related N-acetyltransferase  31.34 
 
 
154 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193882  normal  0.0657736 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1855  acetyltransferase  31.58 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212517 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3373  GCN5-related N-acetyltransferase  28.44 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2046  N-acetylglutamate synthase  35.87 
 
 
444 aa  45.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.398173  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  24.03 
 
 
173 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1363  GCN5-related N-acetyltransferase  24.03 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.933433  hitchhiker  0.000190742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5655  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0802774  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1705  acetyltransferase  27.15 
 
 
147 aa  45.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3015  GCN5-related N-acetyltransferase  24.03 
 
 
169 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3495  GCN5-related N-acetyltransferase  25.93 
 
 
159 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000137557  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1979  acetyltransferase, GNAT family  26.49 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.306431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3757  acetyltransferase  24.63 
 
 
159 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162031  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0940  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
161 aa  45.1  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3557  GCN5-related N-acetyltransferase  25.64 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1901  acetyltransferase, GNAT family  27.15 
 
 
147 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1522  GCN5-related N-acetyltransferase  30.17 
 
 
119 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.542854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  29.13 
 
 
169 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.313385  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0112  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 
164 aa  44.3  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1930  GCN5-related N-acetyltransferase  27.14 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.525718  hitchhiker  0.000000154732 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0198  GCN5-related N-acetyltransferase  26.28 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
139 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.631639  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02663  acetyltransferase  24.67 
 
 
171 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3647  GCN5-related N-acetyltransferase  27.87 
 
 
182 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.972339  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2936  putative acyltransferase  30.25 
 
 
299 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3075  GCN5-related N-acetyltransferase  26.42 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882795  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3406  acetyltransferase  27.97 
 
 
159 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.344947 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1949  acetyltransferase  25.17 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3070  acetyltransferase, GNAT family  28.57 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1727  acetyltransferase  26.49 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  29.82 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1863  acetyltransferase  26.49 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.750595  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1021  GCN5-related N-acetyltransferase  23.14 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0567857  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43627  predicted protein  29.33 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2356  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>