More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0162 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0162  integration host factor, alpha subunit  100 
 
 		 100 aa  202  2e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0107  histone-like DNA-binding protein  87 
 
 		 100 aa  182  9e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0057  HU family DNA-binding protein  55.81 
 
 		 101 aa  91.7  3e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2924  integration host factor, alpha subunit  42.55 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0242436  hitchhiker  0.000500218 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1721  integration host factor subunit alpha  46.15 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0913  integration host factor subunit alpha  45.05 
 
 		 100 aa  84.3  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1783  integration host factor subunit alpha  44.21 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.783563  normal  0.198181 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1863  integration host factor subunit alpha  44.68 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00832208  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1668  integration host factor, alpha subunit  43.48 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3378  integration host factor, alpha subunit  43.01 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4386  integration host factor subunit alpha  39.78 
 
 		 105 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1631  integration host factor subunit alpha  41.76 
 
 		 112 aa  80.1  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1269  integration host factor subunit alpha  42.86 
 
 		 100 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.272817 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2611  integration host factor subunit alpha  42.86 
 
 		 100 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1913  integration host factor subunit alpha  42.86 
 
 		 100 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.749601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3032  integration host factor subunit alpha  40.66 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814183  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0771  integration host factor subunit alpha  42.86 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.801748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1287  integration host factor subunit alpha  41.76 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.921659  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0778  integration host factor subunit alpha  42.86 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2518  integration host factor subunit alpha  42.86 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2365  integration host factor subunit alpha  47.25 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1408  integration host factor subunit alpha  40.62 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.422535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1198  integration host factor subunit alpha  41.76 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0830  integration host factor subunit alpha  40.66 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120813  normal  0.0891496 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1147  integration host factor subunit alpha  40.66 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.205645  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2677  integration host factor subunit alpha  39.58 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00137939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0268  integration host factor, alpha subunit  39.36 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3557  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1587  integration host factor subunit alpha  40.43 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.526192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4630  integration host factor subunit alpha  38.14 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00633863  normal  0.0311538 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0651  integration host factor, alpha subunit  39.36 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2651  integration host factor subunit alpha  38.54 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.030982  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3021  integration host factor subunit alpha  37.5 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1013  integration host factor subunit alpha  42.39 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00925023 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2687  integration host factor subunit alpha  39.36 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2016  histone family protein DNA-binding protein  38.71 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1417  integration host factor, alpha subunit  45.78 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.097817  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3967  histone family protein DNA-binding protein  37.63 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0228483 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1522  integration host factor, alpha subunit  38.71 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00263552  normal  0.735039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7074  integration host factor, alpha subunit  36.46 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15437  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6231  integration host factor, alpha subunit  37.63 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.75949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2055  histone family protein DNA-binding protein  37.63 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2330  histone family protein DNA-binding protein  37.63 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.45414 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  37.5 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  37.5 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  37.63 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067674 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2055  integration host factor subunit alpha  37.11 
 
 		 100 aa  70.1  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1918  histone family protein DNA-binding protein  36.96 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000225021  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4986  histone family protein DNA-binding protein  34.38 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777024  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2356  histone family protein DNA-binding protein  35.87 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  37.23 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3742  integration host factor, alpha subunit  36.17 
 
 		 100 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  0.554438 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3754  histone family protein DNA-binding protein  36.08 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.159868  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1583  integration host factor subunit alpha  35.79 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0639  integration host factor subunit alpha  38.46 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2799  integration host factor subunit alpha  38.04 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1661  integration host factor, alpha subunit  36.96 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1424  integration host factor, alpha subunit  36.56 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000184784  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2853  integration host factor subunit alpha  34.69 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.769617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1454  integration host factor subunit alpha  33.33 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2394  integration host factor subunit alpha  33.33 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1805  integration host factor, alpha subunit  35.42 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3294  integration host factor, alpha subunit  38.04 
 
 		 105 aa  67  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.13347 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3685  histone family protein DNA-binding protein  35.87 
 
 		 93 aa  67  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.166156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2493  integration host factor subunit alpha  36.08 
 
 		 98 aa  67  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.044668  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0181  histone family protein DNA-binding protein  40 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0433  integration host factor subunit alpha  38.54 
 
 		 101 aa  66.6  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3019  integration host factor subunit alpha  37.78 
 
 		 101 aa  66.6  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.616425  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2471  integration host factor subunit alpha  35.42 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2591  integration host factor, alpha subunit  37.78 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.3815  normal  0.0354419 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3219  integration host factor subunit alpha  35.42 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2108  integration host factor subunit alpha  33.33 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.283165  normal  0.12287 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3475  integration host factor subunit alpha  35.42 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981005  hitchhiker  0.00278356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28720  integration host factor subunit alpha  36.46 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000206678  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2510  integration host factor subunit alpha  36.46 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1973  integration host factor subunit alpha  35.42 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0364622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2384  integration host factor, alpha subunit  35.42 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0917658  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2168  integration host factor subunit alpha  35.42 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1937  integration host factor subunit alpha  35.42 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0682795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3057  histone-like DNA-binding protein  32.97 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.581982 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1876  histone family protein DNA-binding protein  34.04 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2538  histone family protein DNA-binding protein  39.36 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1882  integration host factor alpha-subunit  34.74 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.027165 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1751  integration host factor, alpha subunit  34.74 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0308436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1327  integration host factor, alpha subunit  34.04 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.125041  hitchhiker  0.0021642 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2671  integration host factor subunit alpha  37.78 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.998853 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1031  histone family protein DNA-binding protein  36.96 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0376  histone family protein DNA-binding protein  35.42 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.611734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1982  integration host factor subunit alpha  35.42 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219997  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5361  histone family protein DNA-binding protein  38.89 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2967  histone family protein DNA-binding protein  40.66 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.160744  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2622  histone family protein DNA-binding protein  37.36 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3095  integration host factor subunit alpha  32.98 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0706803 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1731  integration host factor subunit alpha  38.89 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.074622  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1342  integration host factor, alpha subunit  32.98 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0180  histone family protein DNA-binding protein  35.56 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1888  histone family protein DNA-binding protein  34.41 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000630839  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1997  integration host factor subunit alpha  37.78 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000120885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0238  histone family protein DNA-binding protein  34.44 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0092  integration host factor, alpha subunit  34.78 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>