96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3745 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3745  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain C  100 
 
 
273 aa  531  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2680  putative anaerobic reductase component  51.28 
 
 
269 aa  254  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2723  putative dimethylsulfoxide reductase  52.01 
 
 
269 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2786  putative dimethylsulfoxide reductase  51.65 
 
 
269 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2898  putative anaerobic reductase component  51.28 
 
 
269 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2767  putative anaerobic reductase component  51.81 
 
 
269 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0129  cyclic nucleotide-binding protein  32.14 
 
 
272 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4688  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  30.04 
 
 
275 aa  98.6  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000613246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2335  hypothetical protein  38.36 
 
 
292 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2344  putative anaerobic reductase component  28.06 
 
 
270 aa  96.3  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.755425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2565  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  31.9 
 
 
275 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000475988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4697  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  31.79 
 
 
277 aa  92.4  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.854228  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4694  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  30.71 
 
 
277 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1282  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  31.98 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000467203  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2336  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  35.33 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0288  hypothetical protein  34.57 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00395524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2253  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  31.71 
 
 
286 aa  79  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.285231  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4568  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  30.03 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336538  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02505  hypothetical protein  34.42 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1689  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  35.06 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0746368 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1278  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  31.82 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.394245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1281  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  26.09 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0549  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  33.5 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1384  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  29.88 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1954  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  31.9 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1948  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  27.73 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0711  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  30.27 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.957914 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2343  DMSO reductase anchor subunit-like protein  30 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.32375  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0771  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  30.27 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0652  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  29.73 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0725  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  29.73 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277992  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0920  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain C  35.71 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.809419  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3392  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  35.71 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0666  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  29.73 
 
 
255 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3259  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  35.71 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01559  oxidoreductase, membrane subunit  32.91 
 
 
284 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01549  hypothetical protein  32.91 
 
 
284 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2040  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.91 
 
 
284 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2053  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.91 
 
 
284 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.572906  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1663  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  32.91 
 
 
284 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1420  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.95 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1797  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  32.28 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1610  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  32.28 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1776  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  32.28 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2299  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  30.97 
 
 
284 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149119 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1598  dmso reductase anchor subunit  31.65 
 
 
285 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448472  normal  0.971647 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4653  dmso reductase anchor subunit  28.37 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1676  dmso reductase anchor subunit  31.01 
 
 
285 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.088493  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1843  dmso reductase anchor subunit  31.01 
 
 
285 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.882429  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1607  dmso reductase anchor subunit  31.65 
 
 
285 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1666  dmso reductase anchor subunit  31.01 
 
 
285 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4653  dmso reductase anchor subunit  32.32 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0972  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  35.66 
 
 
287 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1058  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  35.66 
 
 
287 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4702  dmso reductase anchor subunit  31.93 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00907  hypothetical protein  33.99 
 
 
287 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.115308  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00900  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C  33.99 
 
 
287 aa  56.2  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123294  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2240  hypothetical protein  37.36 
 
 
265 aa  56.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4570  dmso reductase anchor subunit  28.37 
 
 
257 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2700  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.99 
 
 
287 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2747  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.99 
 
 
287 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1001  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  33.99 
 
 
287 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2432  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  33.99 
 
 
287 aa  56.2  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1031  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  31.34 
 
 
287 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2224  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  34.97 
 
 
287 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.83571 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1454  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  28.42 
 
 
258 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2718  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  28.42 
 
 
258 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1342  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  28.42 
 
 
258 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3053  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.79 
 
 
594 aa  55.8  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1000  dmso reductase anchor subunit  33.55 
 
 
287 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1065  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  33.55 
 
 
287 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000142523  normal  0.658942 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1080  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  33.55 
 
 
287 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0971  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  33.55 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4562  dmso reductase anchor subunit  27.91 
 
 
257 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1739  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.34 
 
 
551 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00510  DMSO reductase anchor subunit  29.82 
 
 
287 aa  53.1  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2352  aspartate carbamoyltransferase  29.12 
 
 
615 aa  53.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1227  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  32.52 
 
 
266 aa  52.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.493563  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0933  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  38.71 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1610  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  38.82 
 
 
291 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24580  DMSO reductase anchor subunit  27.4 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1441  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.76 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2961  phenylacetyl-CoA:acceptor oxidoreductase  37.5 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2924  putative anaerobic DMSO reductase chain C anchor subunit  30.17 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00138794  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1236  DMSO reductase anchor subunit  33.33 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.66345  normal  0.0462913 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1677  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  52.17 
 
 
315 aa  46.6  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0495248  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0426  putative dimethyl sulfoxide reductase anchor subunit  28.87 
 
 
288 aa  46.2  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.905194  hitchhiker  0.00000175345 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0572  DMSO reductase chain C  35.42 
 
 
312 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000032468  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3469  oxidoreductase anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  30.49 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0114  Polysulphide reductase NrfD  30.43 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0146  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  30.82 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.345045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1999  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  34.29 
 
 
317 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1572  hypothetical protein  28.4 
 
 
288 aa  43.5  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0769  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.33 
 
 
295 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0466  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.33 
 
 
292 aa  42.7  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598876  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0305  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.2 
 
 
404 aa  42.7  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>