87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3259 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3259  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  100 
 
 
286 aa  557  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3392  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  98.6 
 
 
286 aa  552  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0920  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain C  98.6 
 
 
286 aa  552  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.809419  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1689  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  66.78 
 
 
286 aa  364  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0746368 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1031  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  66.78 
 
 
287 aa  346  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1000  dmso reductase anchor subunit  66.43 
 
 
287 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1065  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  66.08 
 
 
287 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000142523  normal  0.658942 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1080  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  66.43 
 
 
287 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0971  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  66.43 
 
 
287 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00900  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C  65.96 
 
 
287 aa  341  9e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00907  hypothetical protein  65.96 
 
 
287 aa  341  9e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.115308  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1607  dmso reductase anchor subunit  62.94 
 
 
285 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1843  dmso reductase anchor subunit  62.94 
 
 
285 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.882429  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1666  dmso reductase anchor subunit  62.94 
 
 
285 aa  339  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1598  dmso reductase anchor subunit  62.94 
 
 
285 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448472  normal  0.971647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1676  dmso reductase anchor subunit  62.94 
 
 
285 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.088493  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1420  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  63.07 
 
 
287 aa  336  2.9999999999999997e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1001  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  66.32 
 
 
287 aa  333  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2432  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  66.32 
 
 
287 aa  333  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2700  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  66.32 
 
 
287 aa  333  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2747  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  66.32 
 
 
287 aa  333  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72302  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2224  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  66.32 
 
 
287 aa  331  7.000000000000001e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.83571 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1058  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  66.32 
 
 
287 aa  331  8e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0972  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  66.32 
 
 
287 aa  331  8e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1610  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  60.49 
 
 
284 aa  318  6e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1797  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  60.14 
 
 
284 aa  317  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01549  hypothetical protein  59.79 
 
 
284 aa  315  7e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01559  oxidoreductase, membrane subunit  59.79 
 
 
284 aa  315  7e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2053  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  59.79 
 
 
284 aa  315  7e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.572906  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2040  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  59.79 
 
 
284 aa  315  7e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1663  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  59.79 
 
 
284 aa  315  7e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2299  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  59.44 
 
 
284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149119 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1776  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  59.44 
 
 
284 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2253  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  54.36 
 
 
286 aa  311  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.285231  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02505  hypothetical protein  37.1 
 
 
283 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2790  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.04 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0145436 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0466  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.99 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598876  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0426  putative dimethyl sulfoxide reductase anchor subunit  27.02 
 
 
288 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.905194  hitchhiker  0.00000175345 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4568  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  33.33 
 
 
289 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336538  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00510  DMSO reductase anchor subunit  29.59 
 
 
287 aa  100  4e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4702  dmso reductase anchor subunit  33.58 
 
 
257 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2718  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  31.27 
 
 
258 aa  94  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1454  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  31.27 
 
 
258 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1342  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  31.27 
 
 
258 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4653  dmso reductase anchor subunit  32.48 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00530  DMSO reductase anchor subunit  29.03 
 
 
350 aa  87.8  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4570  dmso reductase anchor subunit  32.48 
 
 
257 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0549  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  31.58 
 
 
284 aa  86.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4562  dmso reductase anchor subunit  32.48 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4653  dmso reductase anchor subunit  36.84 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06860  DMSO reductase anchor subunit  27.89 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.139777 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24580  DMSO reductase anchor subunit  28.85 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0129  cyclic nucleotide-binding protein  27.6 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1278  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  25.65 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.394245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1282  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  31.18 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000467203  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2565  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  28.12 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000475988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1954  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  26.6 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1948  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  27.05 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0288  hypothetical protein  30.15 
 
 
265 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00395524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1384  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  27.92 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2680  putative anaerobic reductase component  27.5 
 
 
269 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4688  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  30.3 
 
 
275 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000613246  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0456  hypothetical protein  27.13 
 
 
315 aa  57  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2344  putative anaerobic reductase component  25.7 
 
 
270 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.755425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2335  hypothetical protein  25.83 
 
 
292 aa  55.8  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4697  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  28.06 
 
 
277 aa  55.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.854228  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1281  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  36.11 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370499  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0114  Polysulphide reductase NrfD  30.2 
 
 
292 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2767  putative anaerobic reductase component  27.72 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2898  putative anaerobic reductase component  31.08 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2786  putative dimethylsulfoxide reductase  31.08 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2723  putative dimethylsulfoxide reductase  31.08 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4694  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  30.57 
 
 
277 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2336  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  31.91 
 
 
291 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0771  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  31.85 
 
 
255 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3469  oxidoreductase anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  30.43 
 
 
283 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0711  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  31.21 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.957914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0652  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  31.21 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0725  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  30.57 
 
 
255 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277992  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2924  putative anaerobic DMSO reductase chain C anchor subunit  28.23 
 
 
289 aa  49.7  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00138794  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1572  hypothetical protein  28.82 
 
 
288 aa  49.7  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0666  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  30.57 
 
 
255 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1610  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  32.32 
 
 
291 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3745  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain C  35.8 
 
 
273 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2766  DMSO reductase anchor subunit-like protein  30.2 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.740952 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2352  aspartate carbamoyltransferase  29.24 
 
 
615 aa  46.2  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2240  hypothetical protein  31.91 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>