73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1948 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1948  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  100 
 
 		 277 aa  545  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1954  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  98.56 
 
 		 277 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1281  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  61.15 
 
 		 280 aa  316  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1278  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  59.78 
 
 		 276 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.394245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4697  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  44.68 
 
 		 277 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.854228  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4694  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  44.68 
 
 		 277 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2344  putative anaerobic reductase component  41.97 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.755425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2335  hypothetical protein  40.27 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4688  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  41.73 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000613246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2336  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  36.39 
 
 		 291 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0129  cyclic nucleotide-binding protein  34.64 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2565  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  37.99 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000475988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4568  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  35.71 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336538  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2343  DMSO reductase anchor subunit-like protein  32.97 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.32375  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1384  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  32.5 
 
 		 283 aa  90.5  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1282  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  29.68 
 
 		 272 aa  85.5  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000467203  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2680  putative anaerobic reductase component  29.18 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2767  putative anaerobic reductase component  33.53 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2898  putative anaerobic reductase component  33.53 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2786  putative dimethylsulfoxide reductase  33.53 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0549  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  30.63 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2723  putative dimethylsulfoxide reductase  33.53 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0288  hypothetical protein  31.18 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00395524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2253  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  30.9 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.285231  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00900  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C  31.78 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2224  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  31.49 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.83571 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00907  hypothetical protein  31.78 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.115308  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0972  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  32.14 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1058  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  32.14 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2432  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  31.7 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2747  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  31.7 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72302  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2700  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  31.7 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1001  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  31.7 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1000  dmso reductase anchor subunit  30.94 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1080  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  30.94 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1065  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  30.94 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000142523  normal  0.658942 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1031  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  30.94 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0971  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  31.39 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1689  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  26.43 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0746368 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1420  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  31.49 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2718  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  28.57 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1454  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  28.57 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1342  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  28.57 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3745  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain C  31.52 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02505  hypothetical protein  28.21 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0920  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain C  31.34 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.809419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3392  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  31.34 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3259  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  26.94 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2240  hypothetical protein  29.03 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1227  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  37.89 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.493563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2299  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  25.8 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149119 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1598  dmso reductase anchor subunit  27.74 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448472  normal  0.971647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1843  dmso reductase anchor subunit  27.46 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.882429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1599  DMSO reductase anchor subunit-like protein  29.52 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1607  dmso reductase anchor subunit  27.74 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3469  oxidoreductase anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  31.01 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1610  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  27.27 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01559  oxidoreductase, membrane subunit  27.27 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01549  hypothetical protein  27.27 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2053  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  27.27 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.572906  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1663  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  27.27 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1797  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  27.27 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2040  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  27.27 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1666  dmso reductase anchor subunit  27.11 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1676  dmso reductase anchor subunit  27.74 
 
 		 285 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.088493  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1776  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  27.63 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2924  putative anaerobic DMSO reductase chain C anchor subunit  29.41 
 
 		 289 aa  49.3  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00138794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1610  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  31.85 
 
 		 291 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2798  aspartate carbamoyltransferase  22.65 
 
 		 686 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.604393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4653  dmso reductase anchor subunit  27.27 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3053  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.3 
 
 		 594 aa  42.7  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4562  dmso reductase anchor subunit  26.74 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0114  Polysulphide reductase NrfD  27.18 
 
 		 292 aa  42.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>