86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02505 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02505  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  561  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1689  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  34.64 
 
 
286 aa  165  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0746368 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1420  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  36.27 
 
 
287 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00900  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C  36.27 
 
 
287 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00907  hypothetical protein  36.27 
 
 
287 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.115308  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1843  dmso reductase anchor subunit  35.44 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.882429  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1607  dmso reductase anchor subunit  35.09 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2224  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  36.27 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.83571 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1666  dmso reductase anchor subunit  35.44 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1058  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  35.92 
 
 
287 aa  146  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1001  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  36.27 
 
 
287 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1676  dmso reductase anchor subunit  35.44 
 
 
285 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.088493  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0972  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  35.92 
 
 
287 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2432  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  36.27 
 
 
287 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2700  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  36.27 
 
 
287 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2747  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  36.27 
 
 
287 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72302  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1080  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  36.36 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1000  dmso reductase anchor subunit  36.36 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1065  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  36.36 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000142523  normal  0.658942 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1031  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  36.36 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1598  dmso reductase anchor subunit  35.09 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448472  normal  0.971647 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3392  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  37.46 
 
 
286 aa  145  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0920  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain C  37.46 
 
 
286 aa  145  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.809419  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1610  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  36.14 
 
 
284 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1797  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  36.14 
 
 
284 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0971  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  36.36 
 
 
287 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01549  hypothetical protein  36.14 
 
 
284 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2299  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  36.24 
 
 
284 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149119 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01559  oxidoreductase, membrane subunit  36.14 
 
 
284 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2040  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  36.14 
 
 
284 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2053  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  36.14 
 
 
284 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.572906  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1663  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  36.14 
 
 
284 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3259  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  37.1 
 
 
286 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1776  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  35.79 
 
 
284 aa  143  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2253  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  35.54 
 
 
286 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.285231  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1342  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  31.88 
 
 
258 aa  89.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1454  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  31.88 
 
 
258 aa  89.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2718  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  31.88 
 
 
258 aa  89.4  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4653  dmso reductase anchor subunit  38.99 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4702  dmso reductase anchor subunit  38.61 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4570  dmso reductase anchor subunit  38.61 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4568  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  27.46 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336538  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1278  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  26.09 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.394245  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4653  dmso reductase anchor subunit  37.97 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4562  dmso reductase anchor subunit  37.97 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1282  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  25.82 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000467203  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0129  cyclic nucleotide-binding protein  25.55 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00530  DMSO reductase anchor subunit  28.52 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0549  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  27.4 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1954  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  27.17 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06860  DMSO reductase anchor subunit  27.17 
 
 
288 aa  68.9  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.139777 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2790  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  29.01 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0145436 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1281  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  29.49 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370499  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2924  putative anaerobic DMSO reductase chain C anchor subunit  30.98 
 
 
289 aa  67  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00138794  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3469  oxidoreductase anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  34.41 
 
 
283 aa  65.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1948  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  26.35 
 
 
277 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1384  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  30.17 
 
 
283 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0466  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.88 
 
 
292 aa  63.5  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598876  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2335  hypothetical protein  30.72 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0426  putative dimethyl sulfoxide reductase anchor subunit  28.12 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.905194  hitchhiker  0.00000175345 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4694  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  27.97 
 
 
277 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4688  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  34.36 
 
 
275 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000613246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2565  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  27.92 
 
 
275 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000475988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4697  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  32.7 
 
 
277 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.854228  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24580  DMSO reductase anchor subunit  24.07 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00510  DMSO reductase anchor subunit  27.85 
 
 
287 aa  57  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3745  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain C  34.42 
 
 
273 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2240  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2344  putative anaerobic reductase component  27.92 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.755425  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2723  putative dimethylsulfoxide reductase  31.37 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2786  putative dimethylsulfoxide reductase  31.87 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2680  putative anaerobic reductase component  31.25 
 
 
269 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2767  putative anaerobic reductase component  31.25 
 
 
269 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2898  putative anaerobic reductase component  31.25 
 
 
269 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2336  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  33.63 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0288  hypothetical protein  25 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00395524  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1610  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  34.57 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0114  Polysulphide reductase NrfD  29.53 
 
 
292 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1599  DMSO reductase anchor subunit-like protein  26.87 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0771  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  35.04 
 
 
255 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2352  aspartate carbamoyltransferase  29.41 
 
 
615 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1572  hypothetical protein  28.48 
 
 
288 aa  43.5  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0711  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  33.33 
 
 
255 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.957914 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1227  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  40.66 
 
 
266 aa  42.7  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.493563  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0652  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  34.19 
 
 
255 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0725  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  33.33 
 
 
255 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277992  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>