43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1441 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1441  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  100 
 
 
291 aa  570  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1236  DMSO reductase anchor subunit  57.93 
 
 
295 aa  286  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.66345  normal  0.0462913 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0769  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  43.94 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0572  DMSO reductase chain C  38.1 
 
 
312 aa  142  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000032468  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2644  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  39.23 
 
 
312 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.022311  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1741  hypothetical protein  35.11 
 
 
316 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665621  normal  0.278657 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0338  hypothetical protein  34.15 
 
 
327 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1999  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.12 
 
 
317 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0057  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  35.15 
 
 
327 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1677  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  36.1 
 
 
315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0495248  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4942  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.86 
 
 
316 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743423  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0146  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  30.86 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.345045 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6212  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.23 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1447  DMSO reductase chain C  33.02 
 
 
316 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3108  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  33.02 
 
 
316 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1358  hypothetical protein  33.02 
 
 
316 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2049  hypothetical protein  33.02 
 
 
316 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1074  hypothetical protein  33.02 
 
 
316 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2340  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  33.02 
 
 
316 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58942  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4522  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.6 
 
 
315 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.758783  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3223  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  32.71 
 
 
316 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3813  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.55 
 
 
310 aa  95.9  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.422428  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1934  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  31.87 
 
 
312 aa  94.7  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0858  hypothetical protein  31.61 
 
 
310 aa  87  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1799  DMSO reductase anchor subunit  27.07 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00050464  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3994  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  30.82 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195622  normal  0.0360257 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2352  aspartate carbamoyltransferase  27.56 
 
 
615 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1739  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  65.62 
 
 
551 aa  49.7  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4697  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  40.35 
 
 
277 aa  49.7  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.854228  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3745  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain C  32.76 
 
 
273 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4688  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  35.96 
 
 
275 aa  46.2  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000613246  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0426  putative dimethyl sulfoxide reductase anchor subunit  32.77 
 
 
288 aa  46.2  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.905194  hitchhiker  0.00000175345 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2680  putative anaerobic reductase component  34.87 
 
 
269 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2898  putative anaerobic reductase component  34.87 
 
 
269 aa  45.8  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4694  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  37.72 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2767  putative anaerobic reductase component  34.87 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2723  putative dimethylsulfoxide reductase  34.21 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2786  putative dimethylsulfoxide reductase  34.21 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0466  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  29.52 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598876  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2924  putative anaerobic DMSO reductase chain C anchor subunit  30.3 
 
 
289 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00138794  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1282  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  33.64 
 
 
272 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000467203  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2961  phenylacetyl-CoA:acceptor oxidoreductase  28.43 
 
 
293 aa  42.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.286998  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1281  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  33.61 
 
 
280 aa  42.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>