30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3813 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3813  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  100 
 
 		 310 aa  596  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.422428  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3994  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  79.68 
 
 		 310 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195622  normal  0.0360257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0858  hypothetical protein  73.55 
 
 		 310 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4942  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  52.2 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743423  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1741  hypothetical protein  50.31 
 
 		 316 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665621  normal  0.278657 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0338  hypothetical protein  47.87 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1999  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  48.94 
 
 		 317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6212  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  45.62 
 
 		 317 aa  242  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0057  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  48.17 
 
 		 327 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2340  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  49.38 
 
 		 316 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58942  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3108  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  48.92 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1358  hypothetical protein  49.38 
 
 		 316 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1074  hypothetical protein  49.38 
 
 		 316 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1447  DMSO reductase chain C  48.92 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2049  hypothetical protein  49.38 
 
 		 316 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3223  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  49.38 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4522  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  46.88 
 
 		 315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.758783  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1799  DMSO reductase anchor subunit  40.56 
 
 		 324 aa  179  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00050464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0146  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  31.25 
 
 		 349 aa  129  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.345045 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1677  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  34.08 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0495248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0572  DMSO reductase chain C  34.06 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000032468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1441  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.97 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1934  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.44 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1236  DMSO reductase anchor subunit  34.28 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.66345  normal  0.0462913 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2644  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  39.46 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.022311  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0769  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.12 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1739  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.41 
 
 		 551 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3053  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.51 
 
 		 594 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4568  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  32.2 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336538  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2240  hypothetical protein  31.68 
 
 		 265 aa  43.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>