36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1799 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1799  DMSO reductase anchor subunit  100 
 
 
324 aa  653    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00050464  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0338  hypothetical protein  45.57 
 
 
327 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0057  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  42.51 
 
 
327 aa  245  8e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1741  hypothetical protein  42.99 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665621  normal  0.278657 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1999  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  42.86 
 
 
317 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4942  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  42.94 
 
 
316 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743423  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4522  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  42.94 
 
 
315 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.758783  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6212  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  42.68 
 
 
317 aa  222  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1447  DMSO reductase chain C  40.79 
 
 
316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3108  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  40.79 
 
 
316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2049  hypothetical protein  40.96 
 
 
316 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1074  hypothetical protein  40.96 
 
 
316 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1358  hypothetical protein  40.96 
 
 
316 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2340  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  40.96 
 
 
316 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58942  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3223  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  41.27 
 
 
316 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3813  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  40.56 
 
 
310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.422428  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0858  hypothetical protein  39.81 
 
 
310 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3994  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  40.55 
 
 
310 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195622  normal  0.0360257 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0572  DMSO reductase chain C  29.32 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000032468  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0146  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  28.04 
 
 
349 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.345045 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1677  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  29.05 
 
 
315 aa  94.7  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0495248  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1441  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  28.1 
 
 
291 aa  92.4  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1934  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  30.3 
 
 
312 aa  90.1  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1236  DMSO reductase anchor subunit  27.33 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.66345  normal  0.0462913 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2644  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  36.31 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.022311  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0769  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  26.09 
 
 
295 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1278  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  38.33 
 
 
276 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.394245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1954  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  24.77 
 
 
277 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2335  hypothetical protein  38.24 
 
 
292 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4697  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  36.76 
 
 
277 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.854228  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1739  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.15 
 
 
551 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4694  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  36.76 
 
 
277 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1948  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  27.33 
 
 
277 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4688  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  38.81 
 
 
275 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000613246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1281  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  35.94 
 
 
280 aa  43.1  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2240  hypothetical protein  31.87 
 
 
265 aa  42.7  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>