34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0146 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0146  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  100 
 
 		 349 aa  694    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.345045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0572  DMSO reductase chain C  52.06 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000032468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1677  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  43.87 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0495248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1934  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  43.32 
 
 		 312 aa  202  8e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1741  hypothetical protein  35.74 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665621  normal  0.278657 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0338  hypothetical protein  33.73 
 
 		 327 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4942  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  34.89 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743423  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6212  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.96 
 
 		 317 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1236  DMSO reductase anchor subunit  35.09 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.66345  normal  0.0462913 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0057  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  34.46 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0858  hypothetical protein  32.81 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1999  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.29 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3813  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.19 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.422428  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1441  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  31.65 
 
 		 291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3994  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  31.45 
 
 		 310 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195622  normal  0.0360257 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2644  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  35.99 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.022311  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4522  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  30.67 
 
 		 315 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.758783  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3223  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  32.32 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2340  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  32.01 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58942  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2049  hypothetical protein  32.01 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1358  hypothetical protein  32.01 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1074  hypothetical protein  32.01 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3108  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  32.32 
 
 		 316 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1447  DMSO reductase chain C  32.32 
 
 		 316 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0769  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.54 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1799  DMSO reductase anchor subunit  27.41 
 
 		 324 aa  87.8  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00050464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2352  aspartate carbamoyltransferase  30.05 
 
 		 615 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1739  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.94 
 
 		 551 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02505  hypothetical protein  25.12 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2335  hypothetical protein  31.67 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4697  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  25.75 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.854228  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3053  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.98 
 
 		 594 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1384  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  27.59 
 
 		 283 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4688  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  25.93 
 
 		 275 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000613246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>