33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3994 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3994  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  100 
 
 
310 aa  597  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195622  normal  0.0360257 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3813  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  79.68 
 
 
310 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.422428  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0858  hypothetical protein  67.1 
 
 
310 aa  331  8e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1999  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  49.24 
 
 
317 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1741  hypothetical protein  47.56 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.665621  normal  0.278657 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4942  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  48.16 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743423  normal  0.111633 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0338  hypothetical protein  46.34 
 
 
327 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4522  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  49.85 
 
 
315 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.758783  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6212  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  43.65 
 
 
317 aa  231  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1074  hypothetical protein  48.3 
 
 
316 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1358  hypothetical protein  48.3 
 
 
316 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2049  hypothetical protein  48.3 
 
 
316 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2340  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  48.3 
 
 
316 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58942  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1447  DMSO reductase chain C  47.85 
 
 
316 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3108  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  47.85 
 
 
316 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3223  putative molybdopterin oxidoreductase, membrane anchor subunit  48.3 
 
 
316 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.394572  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0057  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  46.2 
 
 
327 aa  220  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1799  DMSO reductase anchor subunit  41.16 
 
 
324 aa  185  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00050464  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0146  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  30.91 
 
 
349 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.345045 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1677  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  36.13 
 
 
315 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0495248  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1441  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.02 
 
 
291 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0572  DMSO reductase chain C  33.23 
 
 
312 aa  103  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000032468  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1934  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  34.91 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1236  DMSO reductase anchor subunit  32.15 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.66345  normal  0.0462913 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2644  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  40.4 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.022311  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0769  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  36.13 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3053  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.19 
 
 
594 aa  49.3  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2240  hypothetical protein  35.64 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1739  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.83 
 
 
551 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2344  putative anaerobic reductase component  37.18 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.755425  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1598  dmso reductase anchor subunit  28.74 
 
 
285 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448472  normal  0.971647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0549  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  34.65 
 
 
284 aa  42.7  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1607  dmso reductase anchor subunit  27.59 
 
 
285 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>