82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3469 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3469  oxidoreductase anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  100 
 
 		 283 aa  545  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0549  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  36.33 
 
 		 284 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2924  putative anaerobic DMSO reductase chain C anchor subunit  30.17 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00138794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0129  cyclic nucleotide-binding protein  29.58 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4568  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  30.69 
 
 		 289 aa  68.9  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336538  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02505  hypothetical protein  34.41 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2565  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  31.91 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000475988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1281  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  33.95 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370499  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2040  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.3 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1610  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  32.3 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1797  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  32.3 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1663  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  32.3 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01549  hypothetical protein  32.3 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2053  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  32.3 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.572906  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01559  oxidoreductase, membrane subunit  32.3 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2253  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  27.05 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.285231  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1282  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  29.89 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000467203  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0114  Polysulphide reductase NrfD  33.53 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1227  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  31.01 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.493563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2240  hypothetical protein  29.79 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2299  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  32.2 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149119 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1776  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  31.96 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1948  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  31.01 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1954  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  31.01 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1676  dmso reductase anchor subunit  31.25 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.088493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0288  hypothetical protein  28.06 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00395524  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1607  dmso reductase anchor subunit  31.25 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2335  hypothetical protein  30.06 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1598  dmso reductase anchor subunit  30.31 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448472  normal  0.971647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1843  dmso reductase anchor subunit  31.25 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.882429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1278  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  28.11 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.394245  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1666  dmso reductase anchor subunit  31.25 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1384  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  27.31 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1454  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  28.72 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1342  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  28.72 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2718  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  28.72 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2798  aspartate carbamoyltransferase  30.05 
 
 		 686 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.604393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0933  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  41.24 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2336  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  27.93 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1861  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.98 
 
 		 682 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.132192  hitchhiker  0.00000573852 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2766  DMSO reductase anchor subunit-like protein  27.53 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.740952 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4688  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  28.48 
 
 		 275 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000613246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4697  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  26.71 
 
 		 277 aa  52.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.854228  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3259  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  30.19 
 
 		 286 aa  52.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0711  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  30.31 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.957914 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1689  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  28.38 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0746368 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3392  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  30.13 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0666  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  29.68 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0652  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  29.68 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0920  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain C  30.13 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.809419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0725  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  29.68 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0771  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  30.31 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2352  aspartate carbamoyltransferase  28.42 
 
 		 615 aa  49.7  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1599  DMSO reductase anchor subunit-like protein  28.93 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4702  dmso reductase anchor subunit  28.17 
 
 		 257 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4653  dmso reductase anchor subunit  29.94 
 
 		 257 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4694  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  25.09 
 
 		 277 aa  49.3  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00900  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C  27.91 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00907  hypothetical protein  27.91 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.115308  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24580  DMSO reductase anchor subunit  27.48 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4562  dmso reductase anchor subunit  29.94 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3745  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain C  31.1 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06860  DMSO reductase anchor subunit  28.63 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.139777 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4570  dmso reductase anchor subunit  29.94 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2344  putative anaerobic reductase component  25.74 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.755425  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2468  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  37.35 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4653  dmso reductase anchor subunit  29.94 
 
 		 257 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1610  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  31.68 
 
 		 291 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2432  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  27.95 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2224  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  27.95 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.83571 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1001  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  27.95 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0972  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  27.95 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2747  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  27.95 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72302  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2700  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  27.95 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3029  hypothetical protein  28.65 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1058  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  27.95 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0426  putative dimethyl sulfoxide reductase anchor subunit  31.05 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.905194  hitchhiker  0.00000175345 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1420  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  27.68 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00510  DMSO reductase anchor subunit  26.23 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16870  hypothetical protein  26.06 
 
 		 289 aa  43.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1031  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  27.61 
 
 		 287 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22760  DMSO reductase anchor subunit  25 
 
 		 289 aa  42.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>