90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1776 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1776  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  100 
 
 
284 aa  558  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01559  oxidoreductase, membrane subunit  98.59 
 
 
284 aa  550  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2053  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  98.59 
 
 
284 aa  550  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.572906  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01549  hypothetical protein  98.59 
 
 
284 aa  550  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1610  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  98.59 
 
 
284 aa  550  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2040  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  98.59 
 
 
284 aa  550  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1663  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  98.59 
 
 
284 aa  550  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1797  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  99.3 
 
 
284 aa  553  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2299  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  97.89 
 
 
284 aa  500  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149119 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1843  dmso reductase anchor subunit  76.84 
 
 
285 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.882429  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1598  dmso reductase anchor subunit  76.49 
 
 
285 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448472  normal  0.971647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1676  dmso reductase anchor subunit  76.14 
 
 
285 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.088493  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1666  dmso reductase anchor subunit  76.14 
 
 
285 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1607  dmso reductase anchor subunit  76.14 
 
 
285 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1689  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  61.89 
 
 
286 aa  349  4e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0746368 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3259  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  59.44 
 
 
286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0920  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain C  59.44 
 
 
286 aa  311  9e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.809419  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3392  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  59.44 
 
 
286 aa  311  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1080  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  58.04 
 
 
287 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1065  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  57.69 
 
 
287 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000142523  normal  0.658942 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1031  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  58.04 
 
 
287 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1000  dmso reductase anchor subunit  58.04 
 
 
287 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1420  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  58.39 
 
 
287 aa  309  2.9999999999999997e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0971  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  57.69 
 
 
287 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00907  hypothetical protein  57.34 
 
 
287 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.115308  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00900  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit C  57.34 
 
 
287 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2700  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  57.34 
 
 
287 aa  296  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2747  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  57.34 
 
 
287 aa  296  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.72302  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2432  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  57.34 
 
 
287 aa  296  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1001  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  57.34 
 
 
287 aa  296  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2253  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  55.56 
 
 
286 aa  295  8e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.285231  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1058  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  56.64 
 
 
287 aa  294  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0972  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  56.64 
 
 
287 aa  294  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2224  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  56.64 
 
 
287 aa  293  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.83571 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02505  hypothetical protein  36.14 
 
 
283 aa  146  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0426  putative dimethyl sulfoxide reductase anchor subunit  30.25 
 
 
288 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.905194  hitchhiker  0.00000175345 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2790  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  30.42 
 
 
284 aa  102  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0145436 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0466  DMSO reductase anchor subunit (DmsC)  33.33 
 
 
292 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598876  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4702  dmso reductase anchor subunit  33.58 
 
 
257 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1454  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  30.58 
 
 
258 aa  86.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2718  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  30.58 
 
 
258 aa  86.7  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1342  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, C subunit  30.58 
 
 
258 aa  86.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4653  dmso reductase anchor subunit  40.74 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4562  dmso reductase anchor subunit  40.12 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4570  dmso reductase anchor subunit  40.12 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4653  dmso reductase anchor subunit  40.12 
 
 
257 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4568  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  28.37 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336538  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00510  DMSO reductase anchor subunit  31.76 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0549  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  28.47 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00530  DMSO reductase anchor subunit  28.32 
 
 
350 aa  75.9  0.0000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1282  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  28.65 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000467203  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24580  DMSO reductase anchor subunit  28.21 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0129  cyclic nucleotide-binding protein  26.95 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1278  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  28.15 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.394245  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2680  putative anaerobic reductase component  28.99 
 
 
269 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06860  DMSO reductase anchor subunit  25.26 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.139777 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4688  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  29.62 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000613246  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0771  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  32.69 
 
 
255 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0652  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  32.69 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0711  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  32.69 
 
 
255 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.957914 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1384  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  28.83 
 
 
283 aa  63.5  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0666  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  32.05 
 
 
255 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0725  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  32.05 
 
 
255 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.277992  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2786  putative dimethylsulfoxide reductase  28.26 
 
 
269 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2767  putative anaerobic reductase component  28.26 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2898  putative anaerobic reductase component  28.26 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2723  putative dimethylsulfoxide reductase  27.9 
 
 
269 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4694  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  28.1 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4697  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  29.82 
 
 
277 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.854228  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1954  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  27.07 
 
 
277 aa  59.7  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2335  hypothetical protein  29.8 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2336  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  28.19 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1948  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  27.63 
 
 
277 aa  55.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2565  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  28.85 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000475988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3469  oxidoreductase anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  35.15 
 
 
283 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2924  putative anaerobic DMSO reductase chain C anchor subunit  33.33 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00138794  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2240  hypothetical protein  28.87 
 
 
265 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1281  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  29.65 
 
 
280 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0288  hypothetical protein  26.88 
 
 
265 aa  52.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00395524  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1599  DMSO reductase anchor subunit-like protein  26.06 
 
 
270 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1610  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit C  30.82 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2344  putative anaerobic reductase component  25.45 
 
 
270 aa  49.7  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.755425  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3745  putative anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain C  31.21 
 
 
273 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1861  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.14 
 
 
682 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.132192  hitchhiker  0.00000573852 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1572  hypothetical protein  25.8 
 
 
288 aa  46.2  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1227  molybdopterin-containing oxidoreductase membrane anchor subunit  38.3 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.493563  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0114  Polysulphide reductase NrfD  27.14 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2352  aspartate carbamoyltransferase  29.09 
 
 
615 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06140  DMSO reductase anchor subunit  28.05 
 
 
303 aa  43.5  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0456  hypothetical protein  24.83 
 
 
315 aa  42.7  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>