80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00116 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3485  conserved hypothetical protein  99.68 
 
 		 617 aa  1267    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0124  hypothetical protein  97.08 
 
 		 617 aa  1154    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00449065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0110  hypothetical protein  97.24 
 
 		 617 aa  1176    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0222206  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0127  hypothetical protein  86.22 
 
 		 585 aa  1029    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.146537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3542  hypothetical protein  98.22 
 
 		 617 aa  1249    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346994  normal  0.280347 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0119  hypothetical protein  96.6 
 
 		 617 aa  1168    Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0121  hypothetical protein  96.6 
 
 		 617 aa  1168    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0226467  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00115  hypothetical protein  100 
 
 		 617 aa  1273    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0816115  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00116  hypothetical protein  100 
 
 		 617 aa  1273    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.102405  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0172  hypothetical protein  56.94 
 
 		 541 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0171  hypothetical protein  56.58 
 
 		 541 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0180  hypothetical protein  56.41 
 
 		 540 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0171  hypothetical protein  56.58 
 
 		 541 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0177  putative outer membrane protein  57.77 
 
 		 531 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0664  putative outer membrane protein  51.2 
 
 		 516 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3623  hypothetical protein  41.6 
 
 		 463 aa  253  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.48231  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3946  hypothetical protein  37.64 
 
 		 470 aa  252  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3518  hypothetical protein  43.05 
 
 		 481 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.574738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2410  hypothetical protein  44.37 
 
 		 489 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0859513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4586  hypothetical protein  39.62 
 
 		 498 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1695  hypothetical protein  39.81 
 
 		 489 aa  209  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1473  hypothetical protein  45.96 
 
 		 436 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2129  hypothetical protein  42.09 
 
 		 428 aa  204  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0542526  normal  0.106078 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2112  hypothetical protein  42.42 
 
 		 484 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2257  hypothetical protein  43.38 
 
 		 488 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1376  hypothetical protein  42.16 
 
 		 466 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7194  hypothetical protein  37.46 
 
 		 462 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.663693 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5884  hypothetical protein  36.87 
 
 		 466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3041  hypothetical protein  39.16 
 
 		 447 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1538  lipoprotein  48.09 
 
 		 441 aa  198  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1147  hypothetical protein  31.15 
 
 		 541 aa  191  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2323  hypothetical protein  40 
 
 		 421 aa  189  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000821276  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5354  hypothetical protein  39.02 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4142  hypothetical protein  29.52 
 
 		 500 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4346  hypothetical protein  29.4 
 
 		 500 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.595421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3910  hypothetical protein  28.92 
 
 		 501 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.318661  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4027  hypothetical protein  33.14 
 
 		 501 aa  171  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2667  hypothetical protein  37.34 
 
 		 420 aa  170  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4214  hypothetical protein  29.01 
 
 		 500 aa  170  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3819  hypothetical protein  29.45 
 
 		 501 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173842 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4649  hypothetical protein  30.79 
 
 		 486 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3637  hypothetical protein  32.27 
 
 		 582 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3890  hypothetical protein  32.27 
 
 		 560 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4476  hypothetical protein  32.27 
 
 		 560 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3311  hypothetical protein  27.83 
 
 		 483 aa  160  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.694942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0885  hypothetical protein  32.49 
 
 		 541 aa  158  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1484  hypothetical protein  43.85 
 
 		 403 aa  155  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1199  hypothetical protein  31.48 
 
 		 461 aa  154  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.756184 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1462  hypothetical protein  40.69 
 
 		 434 aa  154  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027345 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3854  hypothetical protein  30.9 
 
 		 490 aa  153  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3702  hypothetical protein  38.02 
 
 		 415 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2697  hypothetical protein  32.55 
 
 		 458 aa  151  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00350074  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2200  hypothetical protein  33.42 
 
 		 553 aa  150  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.920316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1130  hypothetical protein  29.09 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1393  hypothetical protein  29.58 
 
 		 476 aa  149  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.458413  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1213  hypothetical protein  32.79 
 
 		 438 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0417  hypothetical protein  31.45 
 
 		 416 aa  147  8.000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0403  hypothetical protein  43.85 
 
 		 478 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.149014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1201  hypothetical protein  43.96 
 
 		 682 aa  145  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706806 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3248  hypothetical protein  30.18 
 
 		 473 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00196068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2937  hypothetical protein  25.47 
 
 		 466 aa  144  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00304135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4077  hypothetical protein  44.2 
 
 		 477 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.844566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2486  hypothetical protein  38.98 
 
 		 755 aa  136  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1561  hypothetical protein  35.83 
 
 		 649 aa  134  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.727046  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3382  hypothetical protein  26.45 
 
 		 488 aa  133  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0653251  normal  0.705051 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01519  hypothetical protein  39.01 
 
 		 605 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3962  hypothetical protein  27.51 
 
 		 442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.514264  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00191  hypothetical protein  30.68 
 
 		 440 aa  127  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1262  hypothetical protein  32.83 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0234925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0540  hypothetical protein  28.93 
 
 		 428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000234519  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3170  hypothetical protein  31.84 
 
 		 547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.257942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2227  hypothetical protein  29.93 
 
 		 508 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000137583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2000  hypothetical protein  29.28 
 
 		 505 aa  112  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.94208e-35 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0409  hypothetical protein  30.81 
 
 		 527 aa  107  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4634  hypothetical protein  33.33 
 
 		 544 aa  104  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149297  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1648  hypothetical protein  30.12 
 
 		 550 aa  104  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0755492  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2395  hypothetical protein  25.68 
 
 		 455 aa  97.8  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165403  hitchhiker  0.00469847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4037  hypothetical protein  28.33 
 
 		 463 aa  90.1  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3789  hypothetical protein  25.6 
 
 		 459 aa  83.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5201  hypothetical protein  26.29 
 
 		 465 aa  78.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>