80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2112 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2112  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  941    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2129  hypothetical protein  87.12 
 
 		 428 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0542526  normal  0.106078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1538  lipoprotein  71.39 
 
 		 441 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1473  hypothetical protein  68.78 
 
 		 436 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3946  hypothetical protein  47.15 
 
 		 470 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3623  hypothetical protein  50.26 
 
 		 463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.48231  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3518  hypothetical protein  44.64 
 
 		 481 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.574738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0664  putative outer membrane protein  55.14 
 
 		 516 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7194  hypothetical protein  39.91 
 
 		 462 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.663693 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2410  hypothetical protein  58.12 
 
 		 489 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0859513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1695  hypothetical protein  47.64 
 
 		 489 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4586  hypothetical protein  47.59 
 
 		 498 aa  230  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3041  hypothetical protein  54.09 
 
 		 447 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2257  hypothetical protein  47.38 
 
 		 488 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0110  hypothetical protein  41 
 
 		 617 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0222206  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5884  hypothetical protein  40.55 
 
 		 466 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3485  conserved hypothetical protein  42.06 
 
 		 617 aa  225  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00115  hypothetical protein  42.06 
 
 		 617 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0816115  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00116  hypothetical protein  42.06 
 
 		 617 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.102405  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2323  hypothetical protein  53.12 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000821276  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0124  hypothetical protein  40.12 
 
 		 617 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00449065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0119  hypothetical protein  40.81 
 
 		 617 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0121  hypothetical protein  40.81 
 
 		 617 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0226467  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0127  hypothetical protein  41.12 
 
 		 585 aa  223  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.146537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3542  hypothetical protein  41.69 
 
 		 617 aa  223  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346994  normal  0.280347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2667  hypothetical protein  42.62 
 
 		 420 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0171  hypothetical protein  52.36 
 
 		 541 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0171  hypothetical protein  52.36 
 
 		 541 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0180  hypothetical protein  52.16 
 
 		 540 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0172  hypothetical protein  52.36 
 
 		 541 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0177  putative outer membrane protein  52.59 
 
 		 531 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1147  hypothetical protein  48.36 
 
 		 541 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1376  hypothetical protein  38.9 
 
 		 466 aa  200  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5354  hypothetical protein  39.42 
 
 		 444 aa  200  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0417  hypothetical protein  49.75 
 
 		 416 aa  195  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1199  hypothetical protein  34.25 
 
 		 461 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.756184 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1213  hypothetical protein  34.58 
 
 		 438 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0885  hypothetical protein  38.3 
 
 		 541 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1462  hypothetical protein  50 
 
 		 434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0540  hypothetical protein  36.52 
 
 		 428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000234519  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0403  hypothetical protein  48.53 
 
 		 478 aa  174  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.149014 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1484  hypothetical protein  48.87 
 
 		 403 aa  173  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1393  hypothetical protein  36.61 
 
 		 476 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.458413  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3910  hypothetical protein  31.22 
 
 		 501 aa  167  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.318661  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3962  hypothetical protein  35.1 
 
 		 442 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.514264  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3311  hypothetical protein  37.29 
 
 		 483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.694942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4027  hypothetical protein  39.45 
 
 		 501 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4649  hypothetical protein  34.21 
 
 		 486 aa  163  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3819  hypothetical protein  39.15 
 
 		 501 aa  163  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173842 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4476  hypothetical protein  39.83 
 
 		 560 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2697  hypothetical protein  36.75 
 
 		 458 aa  162  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00350074  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3890  hypothetical protein  39.83 
 
 		 560 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3637  hypothetical protein  39.83 
 
 		 582 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4346  hypothetical protein  30.59 
 
 		 500 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.595421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4214  hypothetical protein  33.66 
 
 		 500 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4142  hypothetical protein  33.33 
 
 		 500 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2200  hypothetical protein  40.69 
 
 		 553 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.920316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3854  hypothetical protein  33.44 
 
 		 490 aa  156  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3702  hypothetical protein  41.76 
 
 		 415 aa  153  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3248  hypothetical protein  35.42 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00196068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1262  hypothetical protein  32.4 
 
 		 486 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0234925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2000  hypothetical protein  39.9 
 
 		 505 aa  147  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.94208e-35 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2937  hypothetical protein  37.06 
 
 		 466 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00304135  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3382  hypothetical protein  35.32 
 
 		 488 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0653251  normal  0.705051 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1130  hypothetical protein  35.22 
 
 		 511 aa  143  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1201  hypothetical protein  40.66 
 
 		 682 aa  143  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706806 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2227  hypothetical protein  39.9 
 
 		 508 aa  143  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000137583  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00191  hypothetical protein  35.22 
 
 		 440 aa  141  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1648  hypothetical protein  34.74 
 
 		 550 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0755492  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2486  hypothetical protein  37.11 
 
 		 755 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01519  hypothetical protein  34.55 
 
 		 605 aa  137  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3170  hypothetical protein  36.11 
 
 		 547 aa  133  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.257942 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0409  hypothetical protein  36.59 
 
 		 527 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1561  hypothetical protein  38.03 
 
 		 649 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.727046  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4077  hypothetical protein  40.36 
 
 		 477 aa  123  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.844566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3789  hypothetical protein  32.03 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2395  hypothetical protein  34.01 
 
 		 455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165403  hitchhiker  0.00469847 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5201  hypothetical protein  27.32 
 
 		 465 aa  110  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4634  hypothetical protein  34 
 
 		 544 aa  110  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149297  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4037  hypothetical protein  29.15 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>