80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00191 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00191  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  897    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3962  hypothetical protein  36.82 
 
 		 442 aa  242  9e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.514264  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2697  hypothetical protein  35.96 
 
 		 458 aa  229  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00350074  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1393  hypothetical protein  45.9 
 
 		 476 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.458413  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3910  hypothetical protein  39.71 
 
 		 501 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.318661  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4027  hypothetical protein  44.06 
 
 		 501 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3854  hypothetical protein  42.41 
 
 		 490 aa  212  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4346  hypothetical protein  43.36 
 
 		 500 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.595421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4142  hypothetical protein  33.75 
 
 		 500 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4214  hypothetical protein  43.36 
 
 		 500 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3311  hypothetical protein  41.82 
 
 		 483 aa  210  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.694942 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2937  hypothetical protein  38.61 
 
 		 466 aa  210  5e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00304135  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3819  hypothetical protein  45.45 
 
 		 501 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1130  hypothetical protein  37.57 
 
 		 511 aa  206  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4649  hypothetical protein  43.12 
 
 		 486 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1262  hypothetical protein  41.22 
 
 		 486 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0234925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3248  hypothetical protein  37.32 
 
 		 473 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00196068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1147  hypothetical protein  43.27 
 
 		 541 aa  196  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3382  hypothetical protein  38.14 
 
 		 488 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0653251  normal  0.705051 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2323  hypothetical protein  36.91 
 
 		 421 aa  159  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000821276  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1462  hypothetical protein  42.94 
 
 		 434 aa  156  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027345 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0417  hypothetical protein  34.55 
 
 		 416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0885  hypothetical protein  33 
 
 		 541 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1199  hypothetical protein  32.98 
 
 		 461 aa  153  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.756184 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3623  hypothetical protein  43.67 
 
 		 463 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.48231  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1484  hypothetical protein  43.12 
 
 		 403 aa  150  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3946  hypothetical protein  32.48 
 
 		 470 aa  149  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2667  hypothetical protein  33.68 
 
 		 420 aa  147  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1213  hypothetical protein  35.11 
 
 		 438 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00120298  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5884  hypothetical protein  31.35 
 
 		 466 aa  143  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5354  hypothetical protein  33.92 
 
 		 444 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0403  hypothetical protein  37.31 
 
 		 478 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.149014 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4586  hypothetical protein  31.46 
 
 		 498 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7194  hypothetical protein  30.51 
 
 		 462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.663693 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1538  lipoprotein  36 
 
 		 441 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2129  hypothetical protein  34.54 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0542526  normal  0.106078 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1695  hypothetical protein  31.32 
 
 		 489 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1473  hypothetical protein  42.41 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4077  hypothetical protein  39.87 
 
 		 477 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.844566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2112  hypothetical protein  43.67 
 
 		 484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3518  hypothetical protein  35.09 
 
 		 481 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.574738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0664  putative outer membrane protein  37.91 
 
 		 516 aa  129  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2410  hypothetical protein  29.68 
 
 		 489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0859513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3702  hypothetical protein  30.58 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0110  hypothetical protein  33.63 
 
 		 617 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0222206  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0180  hypothetical protein  38.12 
 
 		 540 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1376  hypothetical protein  31.5 
 
 		 466 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0171  hypothetical protein  37.91 
 
 		 541 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0171  hypothetical protein  37.91 
 
 		 541 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0172  hypothetical protein  37.91 
 
 		 541 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0177  putative outer membrane protein  38.12 
 
 		 531 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0124  hypothetical protein  35.53 
 
 		 617 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00449065  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3485  conserved hypothetical protein  33.48 
 
 		 617 aa  126  9e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3041  hypothetical protein  38.73 
 
 		 447 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01519  hypothetical protein  39.76 
 
 		 605 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00116  hypothetical protein  33.48 
 
 		 617 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.102405  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00115  hypothetical protein  33.48 
 
 		 617 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0816115  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3542  hypothetical protein  33.04 
 
 		 617 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346994  normal  0.280347 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0121  hypothetical protein  35.23 
 
 		 617 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0226467  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0119  hypothetical protein  35.23 
 
 		 617 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0127  hypothetical protein  34.72 
 
 		 585 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.146537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2257  hypothetical protein  38.42 
 
 		 488 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2486  hypothetical protein  30.51 
 
 		 755 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1561  hypothetical protein  36.57 
 
 		 649 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.727046  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1201  hypothetical protein  34.25 
 
 		 682 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706806 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3637  hypothetical protein  34.66 
 
 		 582 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3890  hypothetical protein  34.66 
 
 		 560 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4476  hypothetical protein  34.66 
 
 		 560 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0540  hypothetical protein  33.85 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000234519  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4634  hypothetical protein  37.82 
 
 		 544 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149297  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2200  hypothetical protein  34.66 
 
 		 553 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.920316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1648  hypothetical protein  38.55 
 
 		 550 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0755492  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3789  hypothetical protein  33.33 
 
 		 459 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5201  hypothetical protein  29.41 
 
 		 465 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3170  hypothetical protein  30.86 
 
 		 547 aa  96.7  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.257942 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0409  hypothetical protein  34.57 
 
 		 527 aa  95.9  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2000  hypothetical protein  30.28 
 
 		 505 aa  94.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.94208e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2227  hypothetical protein  33 
 
 		 508 aa  94.4  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000137583  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4037  hypothetical protein  26.95 
 
 		 463 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2395  hypothetical protein  27.94 
 
 		 455 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165403  hitchhiker  0.00469847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>