49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2734 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  100 
 
 		 222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  43.26 
 
 		 226 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  44.97 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  36.09 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  33.78 
 
 		 232 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0689  hypothetical protein  29.36 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3853  hypothetical protein  31.39 
 
 		 231 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3499  hypothetical protein  29.15 
 
 		 231 aa  104  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1467  hypothetical protein  29.11 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0400  hypothetical protein  30.04 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  26.7 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3047  putative lipoprotein  26.7 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.566933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3250  hypothetical protein  27.07 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20600  hypothetical protein  27.86 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000461916  normal  0.707445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1768  putative lipoprotein  27.86 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2705  hypothetical protein  26.61 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2516  hypothetical protein  24.43 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3729  hypothetical protein  30.56 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1080  putative lipoprotein  27.4 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00439977  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2569  hypothetical protein  22.55 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3145  hypothetical protein  23.2 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1978  putative outer membrane lipoprotein  29.24 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.931993 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1609  putative lipoprotein  28.49 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2036  putative lipoprotein  27.91 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000423707  unclonable  9.72589e-25 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01399  hypothetical protein  27.91 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1448  putative lipoprotein  28.18 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1744  putative lipoprotein  27.91 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000116724  unclonable  1.13256e-21 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2216  conserved hypothetical protein  27.91 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.90262  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2710  hypothetical protein  23.2 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01388  predicted lipoprotein  27.91 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1513  putative lipoprotein  27.91 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2229  hypothetical protein  27.91 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1724  putative lipoprotein  28.07 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0895113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1721  putative lipoprotein  27.49 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1785  hypothetical protein  27.49 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1554  putative lipoprotein  27.49 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1735  putative lipoprotein  27.49 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0501  hypothetical protein  26.82 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2561  lipoprotein  27.43 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00547331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2114  putative lipoprotein  25.81 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.458545  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3695  hypothetical protein  24.73 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.54497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3425  putative lipoprotein  28.46 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5161  hypothetical protein  28.99 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183646 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0167  hypothetical protein  25.64 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3873  hypothetical protein  24.29 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6350  putative lipoprotein  22.68 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.483058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33730  hypothetical protein  26.7 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2390  hypothetical protein  26.92 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  0.832106 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0410  hypothetical protein  45.1 
 
 		 90 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>