16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5161 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5161  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  443  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183646 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3425  putative lipoprotein  66.19 
 
 		 231 aa  288  4e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2561  lipoprotein  58.29 
 
 		 220 aa  268  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00547331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1448  putative lipoprotein  50.23 
 
 		 220 aa  218  6e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288417  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2390  hypothetical protein  57.21 
 
 		 220 aa  214  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  0.832106 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2114  putative lipoprotein  46.41 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.458545  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3729  hypothetical protein  47.25 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2893  lipoprotein  44.44 
 
 		 222 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000297735  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0400  hypothetical protein  29.55 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  28.47 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  28.99 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  24.08 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  26.47 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0689  hypothetical protein  25.98 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3499  hypothetical protein  24.82 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3853  hypothetical protein  23.2 
 
 		 231 aa  41.6  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.182683 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>