19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0689 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0689  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3853  hypothetical protein  83.12 
 
 		 231 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3499  hypothetical protein  74.67 
 
 		 231 aa  354  5.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  29.95 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  30.46 
 
 		 226 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  29.58 
 
 		 222 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  31.03 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  30.19 
 
 		 232 aa  95.5  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0400  hypothetical protein  24.02 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05427  hypothetical protein  60.87 
 
 		 56 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1080  putative lipoprotein  20.96 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00439977  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2561  lipoprotein  26 
 
 		 220 aa  52  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00547331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3425  putative lipoprotein  24.41 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5161  hypothetical protein  25.98 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183646 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0501  hypothetical protein  20.43 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1448  putative lipoprotein  22.36 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288417  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1467  hypothetical protein  23.63 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3695  hypothetical protein  24.88 
 
 		 217 aa  45.1  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.54497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3729  hypothetical protein  25.22 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>