28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3425 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3425  putative lipoprotein  100 
 
 		 231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5161  hypothetical protein  68 
 
 		 221 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183646 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2561  lipoprotein  62.44 
 
 		 220 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00547331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1448  putative lipoprotein  54.72 
 
 		 220 aa  241  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288417  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2390  hypothetical protein  56.02 
 
 		 220 aa  235  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  0.832106 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2114  putative lipoprotein  52.38 
 
 		 221 aa  231  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.458545  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3729  hypothetical protein  54.27 
 
 		 219 aa  228  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2893  lipoprotein  49.49 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000297735  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0400  hypothetical protein  27.47 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  27.74 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  24.21 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  25.5 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1080  putative lipoprotein  23.32 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00439977  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3853  hypothetical protein  24.8 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  28.46 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3499  hypothetical protein  21.65 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0689  hypothetical protein  24.41 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  27.97 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01388  predicted lipoprotein  27.43 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2229  hypothetical protein  27.43 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1744  putative lipoprotein  27.43 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000116724  unclonable  1.13256e-21 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2036  putative lipoprotein  27.43 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000423707  unclonable  9.72589e-25 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1513  putative lipoprotein  27.43 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01399  hypothetical protein  27.43 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2216  conserved hypothetical protein  27.43 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.90262  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  26.2 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1609  putative lipoprotein  26.86 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1978  putative outer membrane lipoprotein  24.76 
 
 		 223 aa  42  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.931993 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>