18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3853 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3853  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0689  hypothetical protein  83.12 
 
 		 227 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3499  hypothetical protein  79.45 
 
 		 231 aa  363  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  30.99 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  29.44 
 
 		 226 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  27.48 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  28.16 
 
 		 233 aa  92  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  28.21 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0400  hypothetical protein  27.92 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05427  hypothetical protein  65.22 
 
 		 56 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1080  putative lipoprotein  20.98 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00439977  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3425  putative lipoprotein  24.8 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1448  putative lipoprotein  23.12 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288417  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2561  lipoprotein  24.83 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00547331  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0501  hypothetical protein  21.2 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3695  hypothetical protein  24.66 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.54497 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3729  hypothetical protein  23.81 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5161  hypothetical protein  23.2 
 
 		 221 aa  42  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>