44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0037 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  72.28 
 
 		 226 aa  304  7e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  44.12 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0689  hypothetical protein  29.95 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3853  hypothetical protein  27.48 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3499  hypothetical protein  27.43 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1080  putative lipoprotein  30.32 
 
 		 226 aa  98.6  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00439977  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1467  hypothetical protein  32.03 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3047  putative lipoprotein  32.08 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.566933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20600  hypothetical protein  32.71 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000461916  normal  0.707445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1768  putative lipoprotein  32.71 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2516  hypothetical protein  30.63 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0400  hypothetical protein  28.57 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  30.19 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  28.38 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2710  hypothetical protein  30.32 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2569  hypothetical protein  27.72 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2705  hypothetical protein  26.79 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3145  hypothetical protein  27.57 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1978  putative outer membrane lipoprotein  28.02 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.931993 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1735  putative lipoprotein  27.12 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1554  putative lipoprotein  27.12 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1785  hypothetical protein  27.12 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1721  putative lipoprotein  27.12 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1609  putative lipoprotein  28.18 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1724  putative lipoprotein  27.12 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0895113  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2216  conserved hypothetical protein  27.62 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.90262  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01399  hypothetical protein  27.62 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2036  putative lipoprotein  27.62 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000423707  unclonable  9.72589e-25 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01388  predicted lipoprotein  27.62 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1744  putative lipoprotein  27.62 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000116724  unclonable  1.13256e-21 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2229  hypothetical protein  27.62 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1513  putative lipoprotein  27.62 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0167  hypothetical protein  33.63 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3250  hypothetical protein  24.43 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3873  hypothetical protein  27.51 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3425  putative lipoprotein  24.21 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33730  hypothetical protein  28.37 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2561  putative lipoprotein  23.28 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.45576  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6350  putative lipoprotein  29.13 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.483058 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1448  putative lipoprotein  22.75 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288417  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2893  lipoprotein  24.29 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000297735  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2390  hypothetical protein  20.42 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  0.832106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>