27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2669 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0400  hypothetical protein  70.39 
 
 		 233 aa  345  4e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  63.09 
 
 		 232 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  39.01 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  37.23 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  105  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0689  hypothetical protein  31.03 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3853  hypothetical protein  28.16 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3499  hypothetical protein  29.01 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1080  putative lipoprotein  28.3 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00439977  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1467  hypothetical protein  28.74 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0501  hypothetical protein  24.53 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1448  putative lipoprotein  27.96 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288417  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3425  putative lipoprotein  27.74 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0985  putative lipoprotein  28.64 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2893  lipoprotein  26.52 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000297735  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6350  putative lipoprotein  24.49 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.483058 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3729  hypothetical protein  27.54 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3873  hypothetical protein  24.57 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5161  hypothetical protein  28.47 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183646 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2114  putative lipoprotein  24.18 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.458545  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2390  hypothetical protein  25.14 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  0.832106 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1774  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2561  lipoprotein  24.62 
 
 		 220 aa  49.3  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00547331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1604  hypothetical protein  21.99 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  27.54 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2721  hypothetical protein  24.39 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>