43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6350 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6350  putative lipoprotein  100 
 
 		 230 aa  471  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.483058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2710  hypothetical protein  38.19 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3145  hypothetical protein  38.19 
 
 		 273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2569  hypothetical protein  38.19 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  33.18 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2516  hypothetical protein  35.45 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3250  hypothetical protein  32.55 
 
 		 223 aa  132  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20600  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000461916  normal  0.707445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1768  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1978  putative outer membrane lipoprotein  35.29 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.931993 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1735  putative lipoprotein  33.95 
 
 		 222 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1554  putative lipoprotein  33.95 
 
 		 222 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1785  hypothetical protein  33.95 
 
 		 222 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1721  putative lipoprotein  33.95 
 
 		 222 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3873  hypothetical protein  34.29 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1724  putative lipoprotein  33.49 
 
 		 222 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0895113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1609  putative lipoprotein  34.27 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0167  hypothetical protein  33.5 
 
 		 220 aa  121  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2216  conserved hypothetical protein  33.8 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.90262  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01399  hypothetical protein  33.8 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1744  putative lipoprotein  33.8 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000116724  unclonable  1.13256e-21 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2229  hypothetical protein  33.8 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.675861 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01388  predicted lipoprotein  33.8 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1513  putative lipoprotein  33.8 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2036  putative lipoprotein  33.8 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000423707  unclonable  9.72589e-25 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3047  putative lipoprotein  31.16 
 
 		 222 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.566933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2705  hypothetical protein  30.99 
 
 		 226 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4813  hypothetical protein  33.8 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.910755  hitchhiker  0.000170141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3695  hypothetical protein  25.94 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.54497 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0985  putative lipoprotein  32.51 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33730  hypothetical protein  25.45 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  24.56 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1080  putative lipoprotein  26.46 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00439977  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  31.45 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  24.75 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  23.44 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  24.12 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1448  putative lipoprotein  29.03 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288417  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2114  putative lipoprotein  24.22 
 
 		 221 aa  52.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.458545  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0501  hypothetical protein  23.15 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3729  hypothetical protein  29.85 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0400  hypothetical protein  23.65 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2561  putative lipoprotein  23.97 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.45576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>