38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3873 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3873  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  448  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2710  hypothetical protein  38.31 
 
 
225 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2569  hypothetical protein  38.31 
 
 
225 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3145  hypothetical protein  37.31 
 
 
273 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3250  hypothetical protein  35.68 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  31.53 
 
 
225 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6350  putative lipoprotein  36.22 
 
 
230 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.483058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3047  putative lipoprotein  30.7 
 
 
222 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.566933  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2516  hypothetical protein  34.78 
 
 
223 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2705  hypothetical protein  32.2 
 
 
226 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1978  putative outer membrane lipoprotein  34.04 
 
 
223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.931993 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1721  putative lipoprotein  31.02 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1785  hypothetical protein  31.02 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1554  putative lipoprotein  31.02 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1735  putative lipoprotein  31.02 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1724  putative lipoprotein  31.02 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0895113  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20600  hypothetical protein  29.35 
 
 
224 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000461916  normal  0.707445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0167  hypothetical protein  32.45 
 
 
220 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1768  putative lipoprotein  29.35 
 
 
224 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1609  putative lipoprotein  31.02 
 
 
222 aa  101  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1744  putative lipoprotein  30.56 
 
 
222 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000116724  unclonable  1.13256e-21 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2216  conserved hypothetical protein  30.56 
 
 
222 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.90262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2036  putative lipoprotein  30.56 
 
 
222 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000423707  unclonable  9.72589e-25 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01399  hypothetical protein  30.56 
 
 
222 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2229  hypothetical protein  30.56 
 
 
222 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1513  putative lipoprotein  30.56 
 
 
222 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01388  predicted lipoprotein  30.56 
 
 
222 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4813  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  88.2  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.910755  hitchhiker  0.000170141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3695  hypothetical protein  25.23 
 
 
217 aa  85.1  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.54497 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0985  putative lipoprotein  25.73 
 
 
229 aa  63.5  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33730  hypothetical protein  27.78 
 
 
225 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  27.18 
 
 
226 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  25.4 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  24.57 
 
 
233 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  22.87 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  24.1 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1467  hypothetical protein  25.16 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0501  hypothetical protein  25.15 
 
 
218 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>