40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2710 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2710  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2569  hypothetical protein  96 
 
 		 225 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3145  hypothetical protein  95.11 
 
 		 273 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2516  hypothetical protein  60.09 
 
 		 223 aa  285  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  56.94 
 
 		 225 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3250  hypothetical protein  58.99 
 
 		 223 aa  269  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20600  hypothetical protein  53.92 
 
 		 224 aa  260  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000461916  normal  0.707445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1768  putative lipoprotein  53.92 
 
 		 224 aa  260  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3047  putative lipoprotein  57.28 
 
 		 222 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.566933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2705  hypothetical protein  43.3 
 
 		 226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1978  putative outer membrane lipoprotein  40.19 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.931993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1724  putative lipoprotein  40.89 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0895113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1721  putative lipoprotein  40.39 
 
 		 222 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1785  hypothetical protein  40.39 
 
 		 222 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1554  putative lipoprotein  40.39 
 
 		 222 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1735  putative lipoprotein  40.39 
 
 		 222 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0167  hypothetical protein  45.18 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1513  putative lipoprotein  37.14 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01388  predicted lipoprotein  37.14 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2036  putative lipoprotein  37.14 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000423707  unclonable  9.72589e-25 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01399  hypothetical protein  37.14 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2229  hypothetical protein  37.14 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1744  putative lipoprotein  37.14 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000116724  unclonable  1.13256e-21 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2216  conserved hypothetical protein  37.14 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.90262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1609  putative lipoprotein  36.67 
 
 		 222 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3695  hypothetical protein  35.58 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.54497 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3873  hypothetical protein  37.07 
 
 		 223 aa  151  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6350  putative lipoprotein  38.19 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.483058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4813  hypothetical protein  38.27 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.910755  hitchhiker  0.000170141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33730  hypothetical protein  30.81 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  30.45 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  29.57 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  23.74 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1467  hypothetical protein  28.11 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0501  hypothetical protein  25.82 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2561  putative lipoprotein  23.74 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.45576  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1080  putative lipoprotein  27.73 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00439977  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0985  putative lipoprotein  25.81 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1604  hypothetical protein  23.5 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  24.66 
 
 		 232 aa  42.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>