39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_20600 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_20600  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000461916  normal  0.707445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1768  putative lipoprotein  99.55 
 
 
224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2516  hypothetical protein  56.88 
 
 
223 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  57 
 
 
225 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3047  putative lipoprotein  57.21 
 
 
222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.566933  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3250  hypothetical protein  53.36 
 
 
223 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2710  hypothetical protein  53.92 
 
 
225 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2569  hypothetical protein  53.46 
 
 
225 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3145  hypothetical protein  54.31 
 
 
273 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2705  hypothetical protein  49.76 
 
 
226 aa  214  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.229078 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2216  conserved hypothetical protein  40.48 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.90262  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1744  putative lipoprotein  40.48 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000116724  unclonable  1.13256e-21 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2229  hypothetical protein  40.48 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.675861 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01388  predicted lipoprotein  40.48 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1513  putative lipoprotein  40.48 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2036  putative lipoprotein  40.48 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000423707  unclonable  9.72589e-25 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01399  hypothetical protein  40.48 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1609  putative lipoprotein  40 
 
 
222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1785  hypothetical protein  40.76 
 
 
222 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1978  putative outer membrane lipoprotein  40.28 
 
 
223 aa  169  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.931993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1554  putative lipoprotein  40.76 
 
 
222 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1735  putative lipoprotein  40.76 
 
 
222 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1721  putative lipoprotein  40.76 
 
 
222 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1724  putative lipoprotein  40.28 
 
 
222 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0895113  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0167  hypothetical protein  43.88 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4813  hypothetical protein  37.04 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.910755  hitchhiker  0.000170141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3695  hypothetical protein  28.71 
 
 
217 aa  131  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.54497 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6350  putative lipoprotein  32.85 
 
 
230 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.483058 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3873  hypothetical protein  29.73 
 
 
223 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33730  hypothetical protein  32.86 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  32.71 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  27.86 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  34.57 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0501  hypothetical protein  24.88 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1080  putative lipoprotein  26.85 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00439977  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1467  hypothetical protein  26.52 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2561  lipoprotein  28.42 
 
 
220 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00547331  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0985  putative lipoprotein  24.74 
 
 
229 aa  46.2  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  26.29 
 
 
232 aa  45.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>