23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1448 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1448  putative lipoprotein  100 
 
 		 220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288417  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2114  putative lipoprotein  66.52 
 
 		 221 aa  311  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.458545  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2561  lipoprotein  59.11 
 
 		 220 aa  249  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00547331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3425  putative lipoprotein  54.72 
 
 		 231 aa  241  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3729  hypothetical protein  54.46 
 
 		 219 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2390  hypothetical protein  59.11 
 
 		 220 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  0.832106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5161  hypothetical protein  52 
 
 		 221 aa  213  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2893  lipoprotein  46.46 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000297735  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  29.51 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0400  hypothetical protein  29.05 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  27.96 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2721  hypothetical protein  25.79 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116183  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1774  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  51.6  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3853  hypothetical protein  23.12 
 
 		 231 aa  48.5  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0985  putative lipoprotein  29.84 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0689  hypothetical protein  22.36 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  22.75 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1080  putative lipoprotein  21.32 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00439977  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  26.72 
 
 		 226 aa  45.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  21.9 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1467  hypothetical protein  23.26 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6350  putative lipoprotein  27.54 
 
 		 230 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.483058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>