15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2114 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2114  putative lipoprotein  100 
 
 
221 aa  455  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.458545  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1448  putative lipoprotein  66.52 
 
 
220 aa  311  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288417  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2561  lipoprotein  56.19 
 
 
220 aa  245  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00547331  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3425  putative lipoprotein  52.38 
 
 
231 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3729  hypothetical protein  51.23 
 
 
219 aa  223  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2390  hypothetical protein  55.88 
 
 
220 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  0.832106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5161  hypothetical protein  46.77 
 
 
221 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2893  lipoprotein  47.96 
 
 
222 aa  197  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000297735  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0400  hypothetical protein  23.44 
 
 
233 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2721  hypothetical protein  28.05 
 
 
209 aa  55.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116183  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  26.67 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  24.18 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  25.9 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0501  hypothetical protein  24.24 
 
 
218 aa  42.4  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  22.58 
 
 
225 aa  42  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.823407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>