103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1597 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  100 
 
 
170 aa  332  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  63.1 
 
 
175 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  64.33 
 
 
176 aa  215  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  61.08 
 
 
174 aa  213  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2969  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  58.68 
 
 
172 aa  203  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1868  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  49.43 
 
 
180 aa  174  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3015  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  58.65 
 
 
133 aa  159  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.61 
 
 
171 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  43.48 
 
 
173 aa  131  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  44.79 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1168  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.25 
 
 
172 aa  121  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.709858  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1629  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.12 
 
 
175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.301211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3682  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  41.61 
 
 
180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1695  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.16 
 
 
181 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000630724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4308  hypothetical protein  41.36 
 
 
174 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3344  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  49.64 
 
 
177 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1156  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.69 
 
 
407 aa  85.9  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.643231  normal  0.0925546 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1835  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.8 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2804  hypothetical protein  33.14 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.44 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  44.44 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4882  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.84 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437819  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0788  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.36 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0768937  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6934  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.72 
 
 
191 aa  67.4  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0812  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.56 
 
 
462 aa  67  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0512  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.09 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11778  hypothetical protein  30.94 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1028  hypothetical protein  31.11 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.637792  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0269  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.24 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1463  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.69 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3116  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.95 
 
 
191 aa  62.4  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3331  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.43 
 
 
186 aa  62.4  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286233  hitchhiker  0.0021122 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2678  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.9 
 
 
191 aa  62  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.782906  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2596  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.19 
 
 
171 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  33.33 
 
 
359 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  32.89 
 
 
385 aa  59.7  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2608  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.81 
 
 
186 aa  58.9  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12633  hypothetical protein  30.05 
 
 
185 aa  58.2  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.318164  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1214  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.63 
 
 
100 aa  57.4  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0826897  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1366  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.22 
 
 
182 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0855  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.69 
 
 
142 aa  55.5  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000829035 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2716  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.52 
 
 
171 aa  53.9  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.653376  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4108  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.16 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.629553  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2811  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.12 
 
 
171 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647947  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0556  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.37 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0682  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.06 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  30.49 
 
 
352 aa  52  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  29.81 
 
 
373 aa  51.6  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.13 
 
 
412 aa  51.6  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0104  hypothetical protein  28.49 
 
 
187 aa  51.6  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.313018 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  29.27 
 
 
352 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.27 
 
 
334 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2107  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.17 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  27.67 
 
 
344 aa  50.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  29.27 
 
 
352 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  29.27 
 
 
349 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4076  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.98 
 
 
143 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0200066  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2423  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.58 
 
 
174 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  29.27 
 
 
352 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.88 
 
 
352 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.12 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  30.49 
 
 
375 aa  48.5  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0171  YeeE/YedE  28.05 
 
 
162 aa  48.1  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.96637  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.7 
 
 
180 aa  47.8  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  28.66 
 
 
352 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.14 
 
 
368 aa  47.4  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.2 
 
 
183 aa  47.4  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  29.22 
 
 
359 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  29.22 
 
 
359 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.07 
 
 
330 aa  47.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2820  YeeE/YedE  30.84 
 
 
170 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0372  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.01 
 
 
415 aa  46.2  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.04 
 
 
354 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0329  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.96 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4315  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.21 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3703  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.31 
 
 
185 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.96 
 
 
144 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  44.64 
 
 
332 aa  45.1  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0457  hypothetical protein  27.27 
 
 
135 aa  44.7  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4161  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.11 
 
 
360 aa  44.7  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0397  hypothetical protein  27.27 
 
 
136 aa  44.7  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1027  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.59 
 
 
145 aa  44.7  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.77187  normal  0.911099 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.14 
 
 
412 aa  44.3  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1716  YeeE/YedE  29.47 
 
 
135 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.539971  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2630  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.31 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0585  hypothetical protein  33.71 
 
 
139 aa  43.9  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1086  YeeE/YedE family protein  34.62 
 
 
144 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.27 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3332  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.85 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299236  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1570  hypothetical protein  33.71 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1499  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.31 
 
 
162 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0258  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.13 
 
 
163 aa  43.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0829  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.91 
 
 
409 aa  42.4  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2497  integral membrane protein  28.09 
 
 
139 aa  42.4  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0191  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.83 
 
 
145 aa  42  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1097  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.18 
 
 
355 aa  42  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3826  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.39 
 
 
405 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000399635 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2077  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.79 
 
 
136 aa  42  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3387  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.3 
 
 
184 aa  42  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.487113  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3453  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.77 
 
 
371 aa  41.2  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>