120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3116 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3116  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 		 191 aa  377  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6934  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  68.62 
 
 		 191 aa  275  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4882  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  64.17 
 
 		 187 aa  261  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3331  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  61.83 
 
 		 186 aa  227  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286233  hitchhiker  0.0021122 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0269  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  57.22 
 
 		 187 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2678  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  53.68 
 
 		 191 aa  201  7e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.782906  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1028  hypothetical protein  53.48 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.637792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0104  hypothetical protein  54.3 
 
 		 187 aa  178  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.313018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2608  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.06 
 
 		 186 aa  167  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.52 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11778  hypothetical protein  46.45 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12633  hypothetical protein  44.5 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.318164  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.96 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0585  hypothetical protein  33.13 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0171  YeeE/YedE  31.61 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.96637  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2497  integral membrane protein  31.07 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2718  hypothetical protein  35.12 
 
 		 144 aa  62  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.814513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0855  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.81 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000829035 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4308  hypothetical protein  31.44 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3143  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  55.77 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.151117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  54 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5675  putative transporter component domain-containing protein  64.44 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1086  YeeE/YedE family protein  42.5 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1883  YeeE/YedE family membrane protein  58 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1026  putative transmembrane protein  60.87 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304948  normal  0.155882 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0329  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  69.05 
 
 		 144 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1493  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  60.87 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1027  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  57.41 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.77187  normal  0.911099 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4036  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  65.12 
 
 		 144 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0233  YeeE/YedE  58.7 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3904  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  57.14 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.110227  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0438  hypothetical protein  57.69 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.616071 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3555  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  65.12 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4717  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  53.85 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  66.67 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5568  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50.82 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0812  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  50.72 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.938577  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3368  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  57.14 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0969639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3295  YeeE/YedE family protein  58.33 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.544227 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0334  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  53.85 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0358  YeeE/YedE family protein  54.9 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1899  YeeE/YedE family protein  54.9 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279304  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1813  YeeE/YedE family protein  54.9 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5807  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  62.22 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0641705  normal  0.400068 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000102  DUF395 domain-containing protein  30.06 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268388  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00084  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  55.77 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3750  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  56.25 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0938  YeeE/YedE family protein  54.9 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0444  YeeE/YedE family protein  54.9 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0203  YeeE/YedE family protein  54.9 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1403  YeeE/YedE family protein  54.9 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.14374  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2448  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  58.33 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1366  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.06 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6241  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  57.69 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.837043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01950  YeeE/YedE family protein  51.92 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1716  YeeE/YedE  43.08 
 
 		 135 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.539971  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3632  hypothetical protein  26.95 
 
 		 140 aa  53.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0397  hypothetical protein  48.21 
 
 		 136 aa  53.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2177  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.45 
 
 		 132 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal  0.163167 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.57 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4846  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  51.92 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2077  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.21 
 
 		 136 aa  52.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1168  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.26 
 
 		 172 aa  52.4  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.709858  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.69 
 
 		 175 aa  52.4  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0457  hypothetical protein  48.21 
 
 		 135 aa  52  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.72 
 
 		 171 aa  52  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2350  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  56.52 
 
 		 144 aa  51.6  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05709  hypothetical protein  28.74 
 
 		 133 aa  51.6  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2519  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  51.2  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0396534 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2107  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  57.14 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4704  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  50 
 
 		 141 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2436  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  48.28 
 
 		 147 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.9 
 
 		 135 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765008  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1570  hypothetical protein  47.06 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1409  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.28 
 
 		 147 aa  50.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0742  hypothetical protein  45.1 
 
 		 145 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2820  YeeE/YedE  27.78 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  27.91 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1618  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  55.56 
 
 		 137 aa  48.9  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000269171  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1878  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  51.02 
 
 		 144 aa  48.9  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.658364  hitchhiker  0.00627314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5603  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  53.33 
 
 		 144 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.81 
 
 		 140 aa  48.5  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0191  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  51.06 
 
 		 145 aa  48.5  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3332  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.14 
 
 		 136 aa  48.9  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299236  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43350  predicted protein  46.94 
 
 		 348 aa  48.5  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0178  hypothetical protein  28.93 
 
 		 145 aa  48.5  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0891988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6793  hypothetical protein  46.43 
 
 		 140 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320556 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  26.26 
 
 		 173 aa  48.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2075  hypothetical protein  45.9 
 
 		 135 aa  48.1  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.718752  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2818  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  53.49 
 
 		 144 aa  48.1  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0425714  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0760  hypothetical protein  43.14 
 
 		 145 aa  47.8  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  52.38 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3703  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.33 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3645  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  51.16 
 
 		 143 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0959  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  44.23 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4076  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.12 
 
 		 143 aa  46.2  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0200066  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1685  YeeE/YedE  27.91 
 
 		 144 aa  45.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1335  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50 
 
 		 143 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000842724 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25 
 
 		 174 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0118  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  51.16 
 
 		 141 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.115789 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>