125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4308 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4308  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  338  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.38 
 
 		 175 aa  117  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.36 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.82 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.07 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  33.94 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2969  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.53 
 
 		 172 aa  94.7  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1695  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.1 
 
 		 181 aa  94.4  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000630724 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  39.29 
 
 		 173 aa  94.4  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.94 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1168  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.82 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.709858  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1868  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.67 
 
 		 180 aa  90.5  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3682  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  35.33 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1629  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.42 
 
 		 175 aa  85.1  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.301211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3344  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.69 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3015  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.88 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4882  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.47 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437819  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1156  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.59 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.643231  normal  0.0925546 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2596  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.39 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4108  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.91 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.629553  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1835  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.78 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0812  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.06 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1463  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.95 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.94 
 
 		 352 aa  62  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  41.94 
 
 		 344 aa  61.6  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0788  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.33 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0768937  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11778  hypothetical protein  27.66 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12633  hypothetical protein  28.12 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.318164  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.09 
 
 		 412 aa  58.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2804  hypothetical protein  30.66 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0269  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.36 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1028  hypothetical protein  48.15 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.637792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  31.69 
 
 		 373 aa  55.8  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2678  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.42 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.782906  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3116  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.02 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6934  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.63 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0556  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.17 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2608  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.08 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0512  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0855  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.37 
 
 		 142 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000829035 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1570  hypothetical protein  43.16 
 
 		 136 aa  52.8  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1366  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.36 
 
 		 182 aa  51.6  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2350  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.79 
 
 		 144 aa  50.8  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1716  YeeE/YedE  47.27 
 
 		 135 aa  50.8  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.539971  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.33 
 
 		 412 aa  50.8  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1026  putative transmembrane protein  38.61 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304948  normal  0.155882 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  30.63 
 
 		 344 aa  50.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2716  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.18 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.653376  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2077  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  51.92 
 
 		 136 aa  49.3  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.44 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0104  hypothetical protein  29.23 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.313018 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2811  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.18 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3331  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.44 
 
 		 186 aa  47.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286233  hitchhiker  0.0021122 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00084  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.02 
 
 		 142 aa  47.8  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4036  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.7 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0178  hypothetical protein  36.19 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0891988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2820  YeeE/YedE  34.74 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1618  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  64.86 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000269171  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3016  YeeE/YedE family protein  44.44 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0760  hypothetical protein  26.83 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0191  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.48 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3555  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.78 
 
 		 127 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1214  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0826897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48 
 
 		 135 aa  45.8  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765008  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.24 
 
 		 140 aa  44.7  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6241  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  55.56 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.837043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2423  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.98 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0742  hypothetical protein  32.95 
 
 		 145 aa  44.7  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2107  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.87 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2497  integral membrane protein  46.34 
 
 		 139 aa  44.7  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43350  predicted protein  42.86 
 
 		 348 aa  44.7  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3776  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.34 
 
 		 373 aa  44.7  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2075  hypothetical protein  48 
 
 		 135 aa  44.3  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.718752  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4146  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.48 
 
 		 141 aa  44.3  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0457  hypothetical protein  42.31 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02370  conserved hypothetical protein  42 
 
 		 348 aa  43.9  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.621696  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0171  YeeE/YedE  27.65 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.96637  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6793  hypothetical protein  38.89 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320556 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0397  hypothetical protein  42.31 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2177  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.65 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal  0.163167 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0313  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.65 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647959  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3368  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0969639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0329  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  55.56 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000102  DUF395 domain-containing protein  45.65 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268388  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  38.89 
 
 		 385 aa  43.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1086  YeeE/YedE family protein  46.3 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.38 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1478  putative inner membrane protein  27.66 
 
 		 414 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0812  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.43 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.938577  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2895  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.17 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5807  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0641705  normal  0.400068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  55.56 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1335  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.64 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000842724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1916  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  53.49 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0233  YeeE/YedE  47.83 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1883  YeeE/YedE family membrane protein  33.94 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5675  putative transporter component domain-containing protein  48.94 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3332  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.86 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299236  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.17 
 
 		 352 aa  42.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1409  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.35 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>