115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3016 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3016  YeeE/YedE family protein  100 
 
 		 175 aa  348  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2497  integral membrane protein  45.52 
 
 		 139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4146  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  49.3 
 
 		 141 aa  108  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5807  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.83 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0641705  normal  0.400068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0118  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50.7 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.115789 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1493  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  50 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2895  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.85 
 
 		 141 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3143  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.51 
 
 		 144 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.151117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0585  hypothetical protein  47.01 
 
 		 139 aa  101  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3368  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.59 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0969639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0233  YeeE/YedE  46.97 
 
 		 144 aa  99.8  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2436  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  44.06 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1409  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.06 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2718  hypothetical protein  47.14 
 
 		 144 aa  99  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.814513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1143  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.48 
 
 		 141 aa  99  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0770197  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0760  hypothetical protein  46.27 
 
 		 145 aa  98.6  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3632  hypothetical protein  38.69 
 
 		 140 aa  98.2  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4717  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  49.25 
 
 		 147 aa  98.2  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4846  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  48.23 
 
 		 144 aa  97.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6241  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50 
 
 		 144 aa  97.8  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.837043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5675  putative transporter component domain-containing protein  46.27 
 
 		 145 aa  97.1  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4076  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  49.31 
 
 		 143 aa  97.1  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0200066  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1027  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.26 
 
 		 145 aa  97.4  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.77187  normal  0.911099 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3904  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.87 
 
 		 138 aa  97.1  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.110227  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1302  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.59 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5568  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.45 
 
 		 144 aa  96.7  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1685  YeeE/YedE  46.97 
 
 		 144 aa  95.1  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2350  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.51 
 
 		 144 aa  95.1  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2448  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.24 
 
 		 251 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5603  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.32 
 
 		 144 aa  94.4  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  46.9 
 
 		 141 aa  94.4  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0742  hypothetical protein  45.52 
 
 		 145 aa  94  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  50.37 
 
 		 140 aa  94  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2519  hypothetical protein  43.07 
 
 		 144 aa  93.6  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0396534 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0329  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.99 
 
 		 144 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000102  DUF395 domain-containing protein  43.61 
 
 		 139 aa  93.2  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268388  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3645  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  44.12 
 
 		 143 aa  92.4  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0812  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  43.36 
 
 		 145 aa  92.4  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.938577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0131  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.25 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.403158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.26 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3295  YeeE/YedE family protein  44.06 
 
 		 159 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.544227 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1335  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.55 
 
 		 143 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000842724 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2818  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  45.11 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0425714  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4036  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.38 
 
 		 144 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05709  hypothetical protein  43.75 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1878  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.26 
 
 		 144 aa  88.6  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.658364  hitchhiker  0.00627314 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4704  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  43.66 
 
 		 141 aa  88.6  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00084  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.42 
 
 		 142 aa  88.2  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1570  hypothetical protein  45.8 
 
 		 136 aa  88.2  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1026  putative transmembrane protein  46.22 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304948  normal  0.155882 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3555  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.31 
 
 		 127 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1883  YeeE/YedE family membrane protein  41.48 
 
 		 144 aa  85.1  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0438  hypothetical protein  45.24 
 
 		 144 aa  84.3  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.616071 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2107  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.61 
 
 		 159 aa  84  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6160  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.37 
 
 		 141 aa  84  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2320  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.37 
 
 		 141 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.760277  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3750  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  49.61 
 
 		 145 aa  83.6  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1086  YeeE/YedE family protein  40.34 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3802  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.18 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0730  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  45 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2899  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  44.68 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0855  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.71 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000829035 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0358  YeeE/YedE family protein  41.8 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1899  YeeE/YedE family protein  41.8 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279304  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1813  YeeE/YedE family protein  41.8 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43350  predicted protein  40.3 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01950  YeeE/YedE family protein  44.12 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0178  hypothetical protein  41.27 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0891988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0334  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  45.11 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0191  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.3 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0938  YeeE/YedE family protein  41.8 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0444  YeeE/YedE family protein  41.8 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0203  YeeE/YedE family protein  41.8 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1403  YeeE/YedE family protein  41.8 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.14374  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.15 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6793  hypothetical protein  44.35 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320556 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1743  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.72 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2177  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.52 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal  0.163167 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3726  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.77 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.659917  normal  0.212064 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2820  YeeE/YedE  37.31 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.33 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765008  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0258  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.78 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0959  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.91 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4315  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.23 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0313  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.6 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647959  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2077  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.61 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2075  hypothetical protein  37.5 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.718752  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1916  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.93 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1618  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.88 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000269171  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0397  hypothetical protein  38.4 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0457  hypothetical protein  38.4 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3332  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.89 
 
 		 136 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299236  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02370  conserved hypothetical protein  33.57 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.621696  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3703  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.01 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2598  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.13 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.382048  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.63 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15578  predicted protein  37.93 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.96534  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3387  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.92 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.487113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27411  Conserved hypothetical  31.68 
 
 		 392 aa  55.5  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.207924 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2423  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.59 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>