120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4624 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  100 
 
 		 141 aa  262  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2895  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  67.38 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4146  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  63.57 
 
 		 141 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1143  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  62.86 
 
 		 141 aa  169  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0770197  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1302  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  63.57 
 
 		 141 aa  157  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0118  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  62.86 
 
 		 141 aa  157  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.115789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2320  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  63.57 
 
 		 141 aa  156  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.760277  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6160  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  62.86 
 
 		 141 aa  155  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4846  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  61.59 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2718  hypothetical protein  58.57 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.814513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0131  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  62.41 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.403158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5807  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  60.28 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0641705  normal  0.400068 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1685  YeeE/YedE  57.25 
 
 		 144 aa  147  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1493  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  61.15 
 
 		 145 aa  146  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6241  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  58.16 
 
 		 144 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.837043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5568  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  59.85 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4036  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  56.12 
 
 		 144 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1883  YeeE/YedE family membrane protein  57.14 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3632  hypothetical protein  51.82 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0233  YeeE/YedE  57.75 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1878  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  56.83 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.658364  hitchhiker  0.00627314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3143  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  56.52 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.151117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5603  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  57.14 
 
 		 144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4717  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  56.93 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5675  putative transporter component domain-containing protein  55.32 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0760  hypothetical protein  47.83 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3368  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  58.87 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0969639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  59.23 
 
 		 140 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3555  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  56.69 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1335  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  57.66 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000842724 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0812  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  50.72 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.938577  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0742  hypothetical protein  47.1 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1027  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.83 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.77187  normal  0.911099 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3802  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  55.4 
 
 		 142 aa  127  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2497  integral membrane protein  51.11 
 
 		 139 aa  124  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3645  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  51.05 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0329  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  55 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0191  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  53.96 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000102  DUF395 domain-containing protein  48.57 
 
 		 139 aa  123  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268388  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2519  hypothetical protein  50.71 
 
 		 144 aa  123  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0396534 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0178  hypothetical protein  52.52 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0891988 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1026  putative transmembrane protein  54.61 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304948  normal  0.155882 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2436  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  54.93 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2448  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  49.65 
 
 		 251 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1409  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  54.93 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  54.29 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0438  hypothetical protein  57.14 
 
 		 144 aa  120  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.616071 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3904  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  49.62 
 
 		 138 aa  121  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.110227  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2350  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  54.23 
 
 		 144 aa  120  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00084  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  51.85 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0334  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  54.35 
 
 		 144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2818  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  47.52 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0425714  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0313  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  59.26 
 
 		 141 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647959  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3295  YeeE/YedE family protein  47.52 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.544227 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0855  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  46.56 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000829035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01950  YeeE/YedE family protein  51.08 
 
 		 144 aa  114  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2899  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  55.32 
 
 		 139 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0585  hypothetical protein  45.99 
 
 		 139 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3750  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  54.14 
 
 		 145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4704  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  47.55 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1743  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  53.72 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0938  YeeE/YedE family protein  52.86 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0444  YeeE/YedE family protein  52.86 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0203  YeeE/YedE family protein  52.86 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1403  YeeE/YedE family protein  52.86 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.14374  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0358  YeeE/YedE family protein  52.86 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1899  YeeE/YedE family protein  52.86 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279304  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1813  YeeE/YedE family protein  52.86 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0959  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  51.47 
 
 		 145 aa  103  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6793  hypothetical protein  51.75 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320556 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1086  YeeE/YedE family protein  50.71 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05709  hypothetical protein  45.04 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0397  hypothetical protein  52.71 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.22 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765008  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0457  hypothetical protein  55.93 
 
 		 135 aa  100  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2107  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  44.85 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3332  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50.79 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299236  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2075  hypothetical protein  46.22 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.718752  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1618  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  56.52 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000269171  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1570  hypothetical protein  45.45 
 
 		 136 aa  98.2  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2177  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.73 
 
 		 132 aa  96.7  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal  0.163167 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4076  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.12 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0200066  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2077  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  54.96 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3016  YeeE/YedE family protein  45.53 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5965  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  53.96 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.062377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1916  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  52 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43350  predicted protein  38.85 
 
 		 348 aa  88.6  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1716  YeeE/YedE  48.15 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.539971  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2598  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  48 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.382048  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02370  conserved hypothetical protein  42.22 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.621696  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0730  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  50.39 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.96 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2820  YeeE/YedE  41.35 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3726  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  46.21 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.659917  normal  0.212064 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2423  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.3 
 
 		 174 aa  70.1  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4315  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.12 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0258  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.24 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15578  predicted protein  40.83 
 
 		 348 aa  64.3  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.96534  normal  0.89638 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3387  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.67 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.487113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3703  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>