123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1811 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  100 
 
 
157 aa  302  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2820  YeeE/YedE  57.75 
 
 
170 aa  156  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4315  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.83 
 
 
168 aa  120  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3703  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.92 
 
 
185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2423  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.05 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0258  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.72 
 
 
163 aa  112  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3387  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.08 
 
 
184 aa  112  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.487113  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0682  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.87 
 
 
190 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1499  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.23 
 
 
162 aa  94.7  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00084  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.91 
 
 
142 aa  87  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1143  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.36 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0770197  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2895  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.54 
 
 
141 aa  84  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000102  DUF395 domain-containing protein  36.81 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268388  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0760  hypothetical protein  36.3 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3645  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.65 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301745  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3904  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.04 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.110227  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0855  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.86 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000829035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4146  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.79 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2497  integral membrane protein  36.96 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05709  hypothetical protein  34.51 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5603  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.22 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0118  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.41 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.115789 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0742  hypothetical protein  36.3 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0233  YeeE/YedE  38.93 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2448  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.35 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2320  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.03 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.760277  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1335  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.07 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000842724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1302  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.36 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.66 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43350  predicted protein  39.55 
 
 
348 aa  75.1  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3295  YeeE/YedE family protein  40.6 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.544227 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2718  hypothetical protein  40.28 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.814513  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6160  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.03 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3016  YeeE/YedE family protein  50 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5675  putative transporter component domain-containing protein  41.79 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5807  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.35 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0641705  normal  0.400068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1493  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.5 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2436  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.55 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392126  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2519  hypothetical protein  40 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0396534 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1027  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.24 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.77187  normal  0.911099 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1743  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.06 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1409  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.55 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6241  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.81 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.837043  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0178  hypothetical protein  37.41 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0891988 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0191  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.29 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2350  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.18 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3632  hypothetical protein  39.1 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0812  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.97 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.938577  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0585  hypothetical protein  34.04 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0131  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.6 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.403158  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4704  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.3 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0329  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.26 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1570  hypothetical protein  36.88 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4846  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.52 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0959  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.71 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.23 
 
 
141 aa  67  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2177  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35 
 
 
132 aa  67  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal  0.163167 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.58 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3750  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.86 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3143  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.31 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.151117  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1685  YeeE/YedE  36.09 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0457  hypothetical protein  34.9 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0397  hypothetical protein  34.9 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2077  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44.83 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1883  YeeE/YedE family membrane protein  35.56 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01950  YeeE/YedE family protein  37.93 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02370  conserved hypothetical protein  29.87 
 
 
348 aa  62.4  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.621696  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3331  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  56.86 
 
 
186 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286233  hitchhiker  0.0021122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6793  hypothetical protein  45.68 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1878  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.64 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.658364  hitchhiker  0.00627314 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4076  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.56 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0200066  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3368  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.57 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0969639  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0438  hypothetical protein  38.02 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.616071 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2107  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.06 
 
 
159 aa  61.6  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0730  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.01 
 
 
142 aa  61.6  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4036  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.85 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2678  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.33 
 
 
191 aa  60.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.782906  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3555  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.15 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0334  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.1 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3802  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.35 
 
 
142 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1026  putative transmembrane protein  40.62 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304948  normal  0.155882 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1916  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.52 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3116  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  58.7 
 
 
191 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2598  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.1 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.382048  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1618  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  50 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000269171  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1716  YeeE/YedE  41.11 
 
 
135 aa  58.2  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.539971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2608  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.31 
 
 
186 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4882  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  50 
 
 
187 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437819  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4717  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.84 
 
 
147 aa  57.4  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.5 
 
 
135 aa  57.4  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765008  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2899  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.6 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5568  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.09 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1086  YeeE/YedE family protein  36.36 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2818  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.57 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0425714  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6934  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50 
 
 
191 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2075  hypothetical protein  30 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.718752  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0171  YeeE/YedE  30.2 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.96637  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11778  hypothetical protein  63.41 
 
 
185 aa  55.1  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3332  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.63 
 
 
136 aa  55.1  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299236  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3726  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.1 
 
 
153 aa  54.3  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.659917  normal  0.212064 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>