113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1499 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1499  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 
162 aa  317  6e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3703  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  62.43 
 
 
185 aa  202  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4315  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  68.21 
 
 
168 aa  195  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3387  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  60.22 
 
 
184 aa  194  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.487113  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0682  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  61.49 
 
 
190 aa  191  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0258  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  62.03 
 
 
163 aa  189  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2423  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  63.75 
 
 
174 aa  186  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2820  YeeE/YedE  42.31 
 
 
170 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  43.23 
 
 
157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0855  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000829035 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0585  hypothetical protein  38.85 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000102  DUF395 domain-containing protein  37.12 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268388  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0760  hypothetical protein  35 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2177  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.4 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal  0.163167 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1366  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.4 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3295  YeeE/YedE family protein  39.68 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.544227 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0742  hypothetical protein  35 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3645  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.17 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301745  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4076  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.48 
 
 
143 aa  67  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0200066  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3750  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.86 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3904  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.1 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.110227  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0191  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.84 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.58 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765008  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1086  YeeE/YedE family protein  44.44 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4146  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.4 
 
 
141 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0397  hypothetical protein  34.75 
 
 
136 aa  62  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2075  hypothetical protein  33.58 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.718752  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0178  hypothetical protein  35.71 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0891988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2350  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.04 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0457  hypothetical protein  34.78 
 
 
135 aa  61.2  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2497  integral membrane protein  35.29 
 
 
139 aa  61.2  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  43.21 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3555  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.77 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2448  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.41 
 
 
251 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4036  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.4 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1716  YeeE/YedE  42.7 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.539971  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1743  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  56.25 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5603  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.12 
 
 
144 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.22 
 
 
144 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00084  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.23 
 
 
142 aa  58.2  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1302  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.38 
 
 
141 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2895  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.82 
 
 
141 aa  57.8  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.237334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1143  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.38 
 
 
141 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0770197  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5807  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.6 
 
 
159 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0641705  normal  0.400068 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5675  putative transporter component domain-containing protein  36.36 
 
 
145 aa  57.4  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0329  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.43 
 
 
144 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.85 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3332  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.86 
 
 
136 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299236  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1878  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.38 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.658364  hitchhiker  0.00627314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2320  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.17 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.760277  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1883  YeeE/YedE family membrane protein  33.07 
 
 
144 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2436  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.51 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392126  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05709  hypothetical protein  34.06 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6160  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.4 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1409  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.51 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0938  YeeE/YedE family protein  41.11 
 
 
144 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0358  YeeE/YedE family protein  41.11 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1685  YeeE/YedE  34.13 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0444  YeeE/YedE family protein  41.11 
 
 
144 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0203  YeeE/YedE family protein  41.11 
 
 
144 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1899  YeeE/YedE family protein  41.11 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279304  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1813  YeeE/YedE family protein  41.11 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1403  YeeE/YedE family protein  41.11 
 
 
144 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.14374  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6793  hypothetical protein  41.18 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320556 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3368  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.94 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0969639  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0118  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.34 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.115789 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43350  predicted protein  31.94 
 
 
348 aa  55.1  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.81 
 
 
176 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2519  hypothetical protein  34.29 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0396534 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3016  YeeE/YedE family protein  41.03 
 
 
175 aa  54.3  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2818  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.66 
 
 
144 aa  53.9  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0425714  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3143  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.15 
 
 
144 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.151117  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0959  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.94 
 
 
145 aa  53.9  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4704  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.38 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3632  hypothetical protein  35.38 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0313  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.38 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647959  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6241  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.43 
 
 
144 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.837043  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1026  putative transmembrane protein  42.68 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304948  normal  0.155882 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5965  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.69 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.062377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0131  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.21 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.403158  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2107  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.97 
 
 
159 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2899  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  52 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2077  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.93 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1493  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.94 
 
 
145 aa  51.6  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1335  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.04 
 
 
143 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000842724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1916  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.24 
 
 
140 aa  51.2  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  32.48 
 
 
173 aa  50.8  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0233  YeeE/YedE  33.08 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1027  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.29 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.77187  normal  0.911099 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4846  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.15 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2718  hypothetical protein  34.13 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.814513  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3726  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.21 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.659917  normal  0.212064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01950  YeeE/YedE family protein  36.22 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0334  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.92 
 
 
144 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4717  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40 
 
 
147 aa  47.8  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1618  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  55.56 
 
 
137 aa  47.4  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000269171  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0438  hypothetical protein  36.26 
 
 
144 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.616071 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.31 
 
 
174 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02370  conserved hypothetical protein  53.19 
 
 
348 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.621696  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27411  Conserved hypothetical  34.18 
 
 
392 aa  46.2  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.207924 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>