28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1835 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1835  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 		 177 aa  350  5.9999999999999994e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2804  hypothetical protein  70.48 
 
 		 180 aa  248  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3682  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  37.42 
 
 		 180 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  43.8 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3344  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.82 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1695  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.72 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000630724 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1156  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  43.75 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.643231  normal  0.0925546 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  35.62 
 
 		 344 aa  78.6  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.62 
 
 		 352 aa  78.6  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1868  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.68 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.37 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0812  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.76 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1168  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.65 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.709858  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.84 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  39.34 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4308  hypothetical protein  38.78 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2969  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.02 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.06 
 
 		 175 aa  62  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1214  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.35 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0826897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  32.16 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1463  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.82 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.57 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0788  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.02 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0768937  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3015  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  43.94 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1629  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.52 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.301211 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0512  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.07 
 
 		 176 aa  44.3  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2596  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.14 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0171  YeeE/YedE  29.59 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.96637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>