74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1168 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1168  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 		 172 aa  338  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.709858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  43.56 
 
 		 175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  41.36 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.38 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.76 
 
 		 174 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.85 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2969  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.85 
 
 		 172 aa  124  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.13 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.25 
 
 		 170 aa  121  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1695  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.86 
 
 		 181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000630724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1629  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.41 
 
 		 175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.301211 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1868  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.89 
 
 		 180 aa  108  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3682  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  39.51 
 
 		 180 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4308  hypothetical protein  38.82 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3015  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.4 
 
 		 133 aa  87.4  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2596  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.14 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3344  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.71 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0788  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.96 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0768937  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1835  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.65 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2804  hypothetical protein  35.09 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4108  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.35 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.629553  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0556  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.81 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1156  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.1 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.643231  normal  0.0925546 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1366  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.4 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4882  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.41 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437819  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  41.98 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.98 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1463  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.57 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0812  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.58 
 
 		 462 aa  55.1  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11778  hypothetical protein  29.58 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2716  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.72 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.653376  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2608  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.8 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3116  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.26 
 
 		 191 aa  52.4  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2811  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.72 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647947  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  39.78 
 
 		 385 aa  51.6  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6934  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.47 
 
 		 191 aa  51.2  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0512  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.85 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1028  hypothetical protein  25.97 
 
 		 185 aa  48.5  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.637792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2678  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.6 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.782906  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12633  hypothetical protein  27.46 
 
 		 185 aa  47.8  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.318164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0269  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.18 
 
 		 187 aa  47.4  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2630  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.52 
 
 		 171 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2119  hypothetical protein  32.71 
 
 		 359 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0187465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2082  hypothetical protein  32.71 
 
 		 359 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000100553  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0171  YeeE/YedE  29.58 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.96637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3126  YeeE/YedE  32.89 
 
 		 361 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  52.17 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2820  YeeE/YedE  30.84 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0104  hypothetical protein  27.81 
 
 		 187 aa  45.1  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.313018 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.03 
 
 		 334 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3776  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.24 
 
 		 373 aa  45.1  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  28.03 
 
 		 349 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  28.03 
 
 		 352 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  28.03 
 
 		 352 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  28.03 
 
 		 352 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2107  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.93 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3909  hypothetical protein  34.29 
 
 		 353 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3331  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.81 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286233  hitchhiker  0.0021122 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  26.75 
 
 		 352 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1627  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.39 
 
 		 352 aa  43.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.275433 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  34.78 
 
 		 359 aa  42.7  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2350  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.89 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02370  conserved hypothetical protein  31.91 
 
 		 348 aa  42.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.621696  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.57 
 
 		 180 aa  42  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1214  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.21 
 
 		 100 aa  42  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0826897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1047  YeeE/YedE family membrane protein  27.39 
 
 		 352 aa  42  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.588627  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.52 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0258  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.48 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1966  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.88 
 
 		 421 aa  41.2  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  29.65 
 
 		 375 aa  41.2  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27482  predicted protein  37.66 
 
 		 338 aa  41.2  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0682  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.5 
 
 		 190 aa  41.2  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27411  Conserved hypothetical  46.3 
 
 		 392 aa  41.2  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.207924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1570  hypothetical protein  34.44 
 
 		 136 aa  40.8  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>