102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2997 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 		 187 aa  364  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2608  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  61.5 
 
 		 186 aa  214  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11778  hypothetical protein  56.83 
 
 		 185 aa  197  7.999999999999999e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6934  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.94 
 
 		 191 aa  174  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0269  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50.53 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12633  hypothetical protein  52.97 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.318164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4882  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  45.95 
 
 		 187 aa  167  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437819  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2678  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  46.24 
 
 		 191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.782906  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1028  hypothetical protein  47.03 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.637792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3331  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.11 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286233  hitchhiker  0.0021122 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3116  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.67 
 
 		 191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0104  hypothetical protein  45.36 
 
 		 187 aa  147  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.313018 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  48.44 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.17 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0171  YeeE/YedE  33.33 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.96637  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0855  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.18 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000829035 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2497  integral membrane protein  28.57 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.58 
 
 		 330 aa  53.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1086  YeeE/YedE family protein  46.15 
 
 		 144 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  46.27 
 
 		 157 aa  52  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.76 
 
 		 332 aa  51.2  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2077  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.21 
 
 		 136 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3750  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  49.09 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0742  hypothetical protein  40.28 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1883  YeeE/YedE family membrane protein  50.98 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.76 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.12 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3904  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.67 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.110227  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3143  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.151117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0329  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50 
 
 		 144 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4308  hypothetical protein  44.44 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3645  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.19 
 
 		 143 aa  48.9  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1027  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.43 
 
 		 145 aa  48.5  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.77187  normal  0.911099 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0760  hypothetical protein  38.89 
 
 		 145 aa  48.5  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2436  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  48.15 
 
 		 147 aa  48.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1409  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.15 
 
 		 147 aa  48.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1493  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  46.15 
 
 		 145 aa  48.1  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2718  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  47.8  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.814513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0358  YeeE/YedE family protein  41.07 
 
 		 144 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1899  YeeE/YedE family protein  41.07 
 
 		 144 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279304  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1813  YeeE/YedE family protein  41.07 
 
 		 144 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1570  hypothetical protein  51.72 
 
 		 136 aa  47.8  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  51.85 
 
 		 173 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01950  YeeE/YedE family protein  46.3 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0438  hypothetical protein  48.89 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.616071 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5675  putative transporter component domain-containing protein  29.24 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2107  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.48 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.53 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0585  hypothetical protein  29.88 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00084  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  46.15 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1168  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  52.17 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.709858  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3295  YeeE/YedE family protein  43.4 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.544227 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  30.46 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4846  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  48.08 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2448  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.59 
 
 		 251 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1716  YeeE/YedE  47.17 
 
 		 135 aa  45.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.539971  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1878  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.65 
 
 		 144 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.658364  hitchhiker  0.00627314 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.67 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5568  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  56.82 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02370  conserved hypothetical protein  33.64 
 
 		 348 aa  45.4  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.621696  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4717  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  46.15 
 
 		 147 aa  45.4  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0938  YeeE/YedE family protein  39.29 
 
 		 144 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0444  YeeE/YedE family protein  39.29 
 
 		 144 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0203  YeeE/YedE family protein  39.29 
 
 		 144 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1403  YeeE/YedE family protein  39.29 
 
 		 144 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.14374  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0397  hypothetical protein  42.11 
 
 		 136 aa  45.1  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4036  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  51.11 
 
 		 144 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1743  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.91 
 
 		 145 aa  45.1  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1026  putative transmembrane protein  41.18 
 
 		 144 aa  44.7  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304948  normal  0.155882 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0812  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42.86 
 
 		 145 aa  44.7  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.938577  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3016  YeeE/YedE family protein  42.11 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2820  YeeE/YedE  54.76 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0233  YeeE/YedE  43.14 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2899  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  44 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2177  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.82 
 
 		 132 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal  0.163167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3368  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.67 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0969639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6241  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  44 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.837043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1335  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.4 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000842724 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2969  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.07 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43350  predicted protein  29.75 
 
 		 348 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2350  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000102  DUF395 domain-containing protein  27.11 
 
 		 139 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268388  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0457  hypothetical protein  42.11 
 
 		 135 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0191  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  48.08 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3555  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  45.1 
 
 		 127 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0334  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  48.89 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0178  hypothetical protein  48.08 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0891988 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4076  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.17 
 
 		 143 aa  42.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0200066  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5807  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.38 
 
 		 159 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0641705  normal  0.400068 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5603  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3632  hypothetical protein  26.38 
 
 		 140 aa  42  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  52.27 
 
 		 373 aa  42  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.865482  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4704  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  42 
 
 		 141 aa  41.6  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.743459  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.38 
 
 		 352 aa  41.6  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2696  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.38 
 
 		 360 aa  41.2  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6793  hypothetical protein  38.46 
 
 		 140 aa  41.2  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320556 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05709  hypothetical protein  28.49 
 
 		 133 aa  41.2  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  27.38 
 
 		 344 aa  41.6  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1629  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.32 
 
 		 175 aa  41.2  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.301211 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>