121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0104 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0104  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  362  2e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.313018 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4882  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  55.91 
 
 
187 aa  224  6e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437819  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0269  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  57.92 
 
 
187 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6934  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  54.75 
 
 
191 aa  205  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2678  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  54.5 
 
 
191 aa  202  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.782906  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3331  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  55.91 
 
 
186 aa  202  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286233  hitchhiker  0.0021122 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3116  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  54.8 
 
 
191 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11778  hypothetical protein  52.17 
 
 
185 aa  185  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1028  hypothetical protein  52.69 
 
 
185 aa  185  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.637792  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2608  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.35 
 
 
186 aa  171  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12633  hypothetical protein  51.09 
 
 
185 aa  167  6e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.318164  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.36 
 
 
187 aa  164  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.03 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1366  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.58 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.33 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.84 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.43 
 
 
175 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4308  hypothetical protein  32.8 
 
 
174 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0171  YeeE/YedE  31.61 
 
 
162 aa  61.2  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.96637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  29.1 
 
 
173 aa  58.2  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2820  YeeE/YedE  32.74 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0742  hypothetical protein  30 
 
 
145 aa  55.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1168  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.11 
 
 
172 aa  55.5  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.709858  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2497  integral membrane protein  27.88 
 
 
139 aa  54.7  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0812  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.6 
 
 
145 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.938577  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3904  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  49.21 
 
 
138 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.110227  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2177  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.29 
 
 
132 aa  52.8  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal  0.163167 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1629  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.34 
 
 
175 aa  52.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.301211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1811  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.94 
 
 
140 aa  52.4  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0585  hypothetical protein  28.83 
 
 
139 aa  52.4  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3143  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.62 
 
 
144 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.151117  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2818  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.49 
 
 
144 aa  52  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0425714  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.36 
 
 
144 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0329  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.36 
 
 
144 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0760  hypothetical protein  27.22 
 
 
145 aa  51.6  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  25.84 
 
 
175 aa  51.2  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02370  conserved hypothetical protein  40 
 
 
348 aa  50.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.621696  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1086  YeeE/YedE family protein  45.16 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3632  hypothetical protein  29.27 
 
 
140 aa  50.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1493  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  46.43 
 
 
145 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6241  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.76 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.837043  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2436  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  50.98 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392126  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2718  hypothetical protein  28.32 
 
 
144 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.814513  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6793  hypothetical protein  50 
 
 
140 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320556 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0855  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.47 
 
 
142 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000829035 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3368  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.92 
 
 
144 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0969639  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1027  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.99 
 
 
145 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.77187  normal  0.911099 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00084  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.64 
 
 
142 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1409  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50.98 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0233  YeeE/YedE  48.89 
 
 
144 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5675  putative transporter component domain-containing protein  28.31 
 
 
145 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.82 
 
 
174 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4076  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.41 
 
 
143 aa  49.3  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0200066  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5568  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.49 
 
 
144 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2519  hypothetical protein  45.28 
 
 
144 aa  48.5  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0396534 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.98 
 
 
176 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4846  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.74 
 
 
144 aa  48.5  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000102  DUF395 domain-containing protein  25.77 
 
 
139 aa  48.5  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268388  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1883  YeeE/YedE family membrane protein  30.18 
 
 
144 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4717  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.93 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.45 
 
 
330 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01950  YeeE/YedE family protein  40.54 
 
 
144 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3295  YeeE/YedE family protein  43.08 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.544227 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3016  YeeE/YedE family protein  33.05 
 
 
175 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0358  YeeE/YedE family protein  41.67 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1899  YeeE/YedE family protein  41.67 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279304  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1813  YeeE/YedE family protein  41.67 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0788  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  54.9 
 
 
175 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0768937  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0334  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.64 
 
 
144 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3387  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.9 
 
 
184 aa  47  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.487113  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1026  putative transmembrane protein  46.67 
 
 
144 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304948  normal  0.155882 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.67 
 
 
332 aa  46.2  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4315  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  23.91 
 
 
168 aa  45.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3332  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.14 
 
 
136 aa  45.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299236  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2350  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.78 
 
 
144 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2423  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.57 
 
 
174 aa  45.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0540  YeeE/YedE family protein, putative  23.38 
 
 
412 aa  45.4  0.0005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0115974  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2448  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  47.83 
 
 
251 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3776  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.3 
 
 
373 aa  45.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4146  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.59 
 
 
141 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1878  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.99 
 
 
144 aa  45.1  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.658364  hitchhiker  0.00627314 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43350  predicted protein  40.98 
 
 
348 aa  44.7  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1618  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  48.84 
 
 
137 aa  44.7  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000269171  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0457  hypothetical protein  31.71 
 
 
135 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3645  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  45.45 
 
 
143 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301745  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3703  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.28 
 
 
185 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1156  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.9 
 
 
407 aa  44.3  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.643231  normal  0.0925546 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0397  hypothetical protein  31.71 
 
 
136 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2075  hypothetical protein  42.31 
 
 
135 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.718752  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.31 
 
 
135 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765008  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0118  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  46.43 
 
 
141 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.115789 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3750  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  48.84 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0938  YeeE/YedE family protein  39.19 
 
 
144 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0178  hypothetical protein  48.08 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0891988 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0191  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  48.08 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0444  YeeE/YedE family protein  39.19 
 
 
144 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0203  YeeE/YedE family protein  39.19 
 
 
144 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1403  YeeE/YedE family protein  39.19 
 
 
144 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.14374  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5807  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.22 
 
 
159 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0641705  normal  0.400068 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2969  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.07 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>