71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0556 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0556  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 
174 aa  321  3e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0788  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  53.75 
 
 
175 aa  155  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0768937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2596  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.41 
 
 
171 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1463  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.88 
 
 
165 aa  106  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0512  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.52 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4108  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  40.72 
 
 
169 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.629553  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2716  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  42.01 
 
 
171 aa  87.4  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.653376  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2811  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.42 
 
 
171 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  37.13 
 
 
175 aa  85.5  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.8 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2630  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  41.42 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.47 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2969  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.94 
 
 
172 aa  72  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1168  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.33 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.709858  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4308  hypothetical protein  33.73 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.98 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  31.21 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.45 
 
 
175 aa  67  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1629  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.88 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.301211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3682  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  30.59 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.81 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1868  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.61 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3015  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.97 
 
 
133 aa  58.2  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1695  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.7 
 
 
181 aa  57  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000630724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1508  putative inner membrane protein  30.32 
 
 
408 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  28.83 
 
 
344 aa  51.6  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  40.45 
 
 
330 aa  51.6  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0047  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.9 
 
 
180 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17370  putative inner membrane protein  29.68 
 
 
408 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452592  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2804  hypothetical protein  28.4 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1366  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.04 
 
 
182 aa  49.3  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0112  putative inner membrane protein  29.87 
 
 
404 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3344  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.4 
 
 
177 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0111  putative inner membrane protein  29.87 
 
 
404 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1260  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.67 
 
 
402 aa  48.1  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0812  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.45 
 
 
462 aa  48.1  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0107  putative inner membrane protein  29.87 
 
 
404 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0109  putative inner membrane protein  29.87 
 
 
404 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0719  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.1 
 
 
183 aa  47  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0108  putative inner membrane protein  29.87 
 
 
404 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1489  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30 
 
 
412 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0109  putative inner membrane protein  29.87 
 
 
404 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1835  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.83 
 
 
177 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3898  putative inner membrane protein  29.49 
 
 
404 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0372  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.95 
 
 
415 aa  46.2  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0641  putative inner membrane protein  29.49 
 
 
404 aa  46.6  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0619351 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.43 
 
 
412 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0104  putative inner membrane protein  30 
 
 
404 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3810  putative inner membrane protein  29.49 
 
 
404 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1478  putative inner membrane protein  29.11 
 
 
414 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1570  hypothetical protein  40.3 
 
 
136 aa  45.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  32.65 
 
 
385 aa  45.1  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0445  putative inner membrane protein  28.86 
 
 
423 aa  44.3  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0742  hypothetical protein  31.73 
 
 
145 aa  44.3  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2075  hypothetical protein  27.5 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.718752  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0829  putative inner membrane protein  31.54 
 
 
406 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  26.79 
 
 
375 aa  43.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0760  hypothetical protein  30.77 
 
 
145 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0171  YeeE/YedE  30.67 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.96637  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11778  hypothetical protein  45.45 
 
 
185 aa  42.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0729  YeeE/YedE family protein  31.06 
 
 
428 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0716  YeeE/YedE family protein  31.06 
 
 
428 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1028  hypothetical protein  43.4 
 
 
185 aa  41.6  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.637792  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0855  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.67 
 
 
142 aa  41.6  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000829035 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.6 
 
 
135 aa  41.2  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765008  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2224  hypothetical protein  26.79 
 
 
421 aa  41.2  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2820  YeeE/YedE  29.33 
 
 
170 aa  41.2  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0178  hypothetical protein  27.81 
 
 
145 aa  41.2  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0891988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0496  putative inner membrane protein  28.66 
 
 
404 aa  41.2  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0829  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.82 
 
 
409 aa  41.2  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2270  putative inner membrane protein  26.35 
 
 
403 aa  41.2  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0138382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>