36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3015 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3015  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  100 
 
 		 133 aa  268  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  62.6 
 
 		 174 aa  179  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  61.07 
 
 		 176 aa  178  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2969  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  61.24 
 
 		 172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  61.36 
 
 		 175 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  58.65 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1868  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  51.82 
 
 		 180 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  42.4 
 
 		 173 aa  104  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  37.98 
 
 		 171 aa  94.7  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3682  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  45.19 
 
 		 180 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1168  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.4 
 
 		 172 aa  87.4  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.709858  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1629  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.28 
 
 		 175 aa  85.5  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.301211 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1695  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.56 
 
 		 181 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000630724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.82 
 
 		 175 aa  84  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4308  hypothetical protein  35.88 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2804  hypothetical protein  32.06 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3344  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  32.48 
 
 		 344 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.48 
 
 		 352 aa  53.9  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0512  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1156  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.88 
 
 		 407 aa  50.8  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.643231  normal  0.0925546 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1835  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  43.94 
 
 		 177 aa  50.1  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2596  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.41 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0788  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.24 
 
 		 175 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0768937  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  29.13 
 
 		 373 aa  45.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1214  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.29 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0826897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0556  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.97 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1463  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.01 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.55 
 
 		 368 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01902  hypothetical protein  28.79 
 
 		 352 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2304  YeeE/YedE family membrane protein  28.79 
 
 		 349 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2151  YeeE/YedE family membrane protein  28.79 
 
 		 352 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1644  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.79 
 
 		 334 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  28.79 
 
 		 352 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  28.03 
 
 		 352 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4108  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.11 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.629553  normal  0.177629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>