91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0433 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0433  NnrS family protein  100 
 
 		 444 aa  832    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0442  NnrS family protein  98.87 
 
 		 444 aa  821    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.171135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4151  NnrS  43.89 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1702  NnrS family protein  44.84 
 
 		 433 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.82539  normal  0.0719493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1485  NnrS family protein  35.56 
 
 		 434 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0573002 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3397  NnrS family protein  34.1 
 
 		 418 aa  113  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  29.35 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5307  putative heme/copper membrane protein  27.15 
 
 		 401 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0853882  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  27.51 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  29.95 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  29.73 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  28.07 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  28.21 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  27.08 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  33.63 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  33.63 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  27.08 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  27.08 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  29.35 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  29.44 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  26.98 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  27.32 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1235  NnrS  27.67 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00575591  unclonable  0.0000000301222 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3473  NnrS  27.07 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  31.27 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  31.25 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2759  hypothetical protein  31.35 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2821  Heme/copper membrane protein  31.35 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2701  heme/copper membrane protein  31.35 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0614  hypothetical protein  31.35 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1711  hypothetical protein  31.35 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2891  hypothetical protein  31.35 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00927369  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2398  hypothetical protein  31.35 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  32.35 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  31.9 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  28.42 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0918  NnrS  34.35 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.948629  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  30.79 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1798  hypothetical protein  28.32 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.425687  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  28.77 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0720  putative heme-Cu membrane protein (NnrS)  28.28 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3610  NnrS family protein  31.03 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.84805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  29.92 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  25.52 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  28.49 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3288  NnrS family protein  31.02 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451558  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3399  hypothetical protein  29.31 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  27.45 
 
 		 400 aa  57  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2940  NnrS family protein  33.23 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0640  NnrS protein  25.09 
 
 		 445 aa  55.8  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4037  NnrS  28.21 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  26.37 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3791  NnrS  27.49 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2105  NnrS family protein  28.41 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0196977  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1524  NnrS family protein  32.39 
 
 		 394 aa  54.7  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0849  putative ATP synthase F0, A subunit  31.19 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2495  NnrS family protein  34.84 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2425  NnrS family protein  34.84 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194019  normal  0.204544 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  24.37 
 
 		 390 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5672  NnrS family protein  34.45 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0687  NnrS family protein  27.62 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1421  NnrS family protein  26.02 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2168  NnrS  28.08 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1475  NnrS family protein  36.08 
 
 		 399 aa  51.6  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29660  hypothetical protein  29.8 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3037  NnrS family protein  27.47 
 
 		 403 aa  51.2  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2837  NnrS  28.27 
 
 		 403 aa  50.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0722604  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  29.15 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1227  NnrS family protein  23.53 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25611  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  39.8 
 
 		 394 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  29.02 
 
 		 390 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1515  NnrS family protein  28.16 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.329363  normal  0.0719715 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1006  NnrS family protein  29.91 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3182  NnrS family protein  28.33 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  32.94 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4275  NnrS  30.99 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2537  hypothetical protein  34.44 
 
 		 388 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  33.33 
 
 		 398 aa  47  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2362  NnrS family protein  28.28 
 
 		 403 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000703097  decreased coverage  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1288  hypothetical protein  33.11 
 
 		 389 aa  46.6  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0467877  normal  0.017488 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1409  hypothetical protein  33.67 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.922088  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  32.32 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2741  hypothetical protein  31.97 
 
 		 442 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.300362  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2382  hypothetical protein  31.97 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.863987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2905  hypothetical protein  31.97 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0630  hypothetical protein  31.97 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2807  Heme/copper membrane protein  31.97 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.817552  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4289  NnrS  24.58 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2683  hypothetical protein  31.97 
 
 		 407 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3603  NnrS family protein  26.5 
 
 		 403 aa  43.5  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.147714  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1810  hypothetical protein  25.94 
 
 		 407 aa  43.1  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>