45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1421 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1421  NnrS family protein  100 
 
 		 394 aa  770    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0640  NnrS protein  37.25 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3397  NnrS family protein  28.36 
 
 		 418 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211704 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4151  NnrS  27.46 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1702  NnrS family protein  25.07 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.82539  normal  0.0719493 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  27.55 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  23.74 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  26.76 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  23.6 
 
 		 418 aa  57  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  28.16 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  25.06 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  25.06 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  28.7 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  24.08 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  25.25 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  24.62 
 
 		 401 aa  53.1  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  24.62 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0433  NnrS family protein  25.75 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2821  Heme/copper membrane protein  25.73 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2759  hypothetical protein  25.73 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2701  heme/copper membrane protein  25.73 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1798  hypothetical protein  26.57 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.425687  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1711  hypothetical protein  25.73 
 
 		 398 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0614  hypothetical protein  25.73 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2398  hypothetical protein  25.73 
 
 		 398 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0442  NnrS family protein  26.02 
 
 		 444 aa  50.4  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.171135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2891  hypothetical protein  25.73 
 
 		 398 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00927369  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  28.17 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  24.04 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  24.04 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1485  NnrS family protein  32.5 
 
 		 434 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0573002 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  24.15 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6279  NnrS family protein  25.38 
 
 		 403 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.20499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  23.67 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  23.47 
 
 		 394 aa  46.6  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  23.77 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  31.43 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  25.34 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  29.23 
 
 		 432 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  29.79 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  26.9 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  27.53 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2495  NnrS family protein  27.78 
 
 		 390 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2425  NnrS family protein  27.78 
 
 		 390 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194019  normal  0.204544 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  27.91 
 
 		 401 aa  43.9  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>