11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1485 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1485  NnrS family protein  100 
 
 		 434 aa  792    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0573002 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4151  NnrS  38.52 
 
 		 394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1702  NnrS family protein  43.03 
 
 		 433 aa  193  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.82539  normal  0.0719493 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0433  NnrS family protein  35.67 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0442  NnrS family protein  35.44 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.171135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3397  NnrS family protein  32.76 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211704 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1421  NnrS family protein  32.5 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  33.58 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  32.08 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  35.8 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  28.4 
 
 		 390 aa  44.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>