62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4151 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4151  NnrS  100 
 
 		 394 aa  754    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1702  NnrS family protein  49.23 
 
 		 433 aa  275  7e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.82539  normal  0.0719493 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0442  NnrS family protein  43.5 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.171135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0433  NnrS family protein  43 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1485  NnrS family protein  39.25 
 
 		 434 aa  213  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0573002 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3397  NnrS family protein  28.75 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211704 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1421  NnrS family protein  27.46 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2821  Heme/copper membrane protein  34.78 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1798  hypothetical protein  37.88 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.425687  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2398  hypothetical protein  34.78 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1711  hypothetical protein  34.78 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2759  hypothetical protein  34.78 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2701  heme/copper membrane protein  34.78 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2891  hypothetical protein  34.78 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00927369  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0614  hypothetical protein  34.78 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  29.22 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  28.4 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  28.81 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  28.81 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  24.52 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  27.25 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  32.89 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  28.64 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4037  NnrS  33.09 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5307  putative heme/copper membrane protein  24.4 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0853882  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  26.58 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  27.25 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3399  hypothetical protein  30.9 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  26.21 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  28.15 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  27.08 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  33.33 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  33.09 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  27.61 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0640  NnrS protein  23.58 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  32.62 
 
 		 390 aa  54.3  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  28.77 
 
 		 401 aa  53.5  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  28.77 
 
 		 401 aa  53.5  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  30.3 
 
 		 403 aa  53.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1524  NnrS family protein  34.81 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2495  NnrS family protein  32.9 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2425  NnrS family protein  32.9 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194019  normal  0.204544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5672  NnrS family protein  33.64 
 
 		 392 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0849  putative ATP synthase F0, A subunit  30.52 
 
 		 428 aa  49.7  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2105  NnrS family protein  30.63 
 
 		 392 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0196977  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  36.26 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  25.82 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0918  NnrS  30.16 
 
 		 229 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.948629  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2159  NnrS family protein  39.8 
 
 		 398 aa  47.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0400909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  26.01 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  34.15 
 
 		 402 aa  47  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1288  hypothetical protein  31.76 
 
 		 389 aa  47  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0467877  normal  0.017488 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1475  NnrS family protein  35.35 
 
 		 399 aa  47  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  32.29 
 
 		 401 aa  46.6  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  30.77 
 
 		 432 aa  46.6  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1235  NnrS  33.05 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00575591  unclonable  0.0000000301222 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  25.58 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  28.34 
 
 		 390 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03317  hypothetical protein  28.33 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2874  NnrS  32.32 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  27.63 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2322  NnrS family protein  28.31 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138032  normal  0.897473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>